薰衣草基因組測序

來自布魯克大學和加拿大不列顛哥倫比亞大學的一組科學家對英國薰衣草(Lavandula angustifolia)的基因組進行了測序，這是一種在世界各地廣泛種植的經(jīng)濟重要植物。

薰衣草屬于薰衣草屬，具有超過32種形態(tài)不同的物種。

其中，少數(shù)品種包括英國薰衣草，穗薰衣草(Lavandula latifolia)及其雜交品種Lavandin(Lavandula x intermedia)，它們的精油在全球廣泛種植，常用于香水，制藥制劑，化妝品和防腐劑等。

估計生產(chǎn)率超過1,500公噸/年，這些油顯著促進了全球數(shù)十億美元的香精香料行業(yè)。

為了更好地了解控制精油生產(chǎn)，分泌和儲存的基因組成和關(guān)鍵途徑，由不列顛哥倫比亞大學的Soheil Mahmoud博士和布魯克大學的Ping Liang博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組為該研究小組制定了第一份基因組組裝草案。英國薰衣草。

“我們長期研究薰衣草，”馬哈茂德博士說。

“我們一直對這種植物感到好奇：為什么耐旱?為什么它是害蟲耐受的?是什么讓它聞起來如此甜美?“

研究人員發(fā)現(xiàn)，薰衣草具有中等重復(fù)(超過48%的重復(fù)元素)基因組，共有8.7億個堿基對。

它含有62,141個蛋白質(zhì)編碼基因和2,003個RNA編碼基因，其中大部分基因表現(xiàn)出重復(fù)。

“研究人員現(xiàn)在可以獲得淡紫色基因組序列，從這里，他們可以發(fā)現(xiàn)更多關(guān)于植物的信息，”梁博士說。

“鑒于薰衣草的經(jīng)濟地位及其在許多行業(yè)中的精油應(yīng)用，薰衣草草案的基因組序列成為持續(xù)薰衣草研究的重要遺傳資源。”

“描述我們研究結(jié)果的最佳方式是，我們已經(jīng)為發(fā)現(xiàn)薰衣草的遺傳元素建立了路線圖，”Mahmoud博士補充說。

“現(xiàn)在，研究人員可以按照我們的地圖進入曠野，進一步探索。它正在為工廠的未來潛力進行更多分析打開大門。“

“例如，基因組草案可以幫助科學家快速發(fā)現(xiàn)指導(dǎo)精油生產(chǎn)的基因，了解控制這些基因表達的調(diào)控元素，并了解基因組如何作為一個整體運作。”

許多高產(chǎn)薰衣草物種會產(chǎn)生一些不需要的元素，如樟腦。

“薰衣草精油的質(zhì)量在很大程度上取決于油的特征氣味，這取決于某些稱為單萜的植物化學物質(zhì)，”Mahmoud博士解釋說。

“樟腦有助于產(chǎn)生異味，它在油中的存在降低了質(zhì)量和市場價值。另一方面，薰衣草油中需要高含量的芳樟醇和乙酸芳樟酯。“

此外，基因組序列可以幫助研究人員開發(fā)用于“指紋識別”和各種薰衣草物種和品種鑒定的遺傳標記。

該團隊的成果發(fā)表在Planta雜志上。

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