研究人員重建野生小麥的基因組
由特拉維夫大學(xué)科學(xué)家Assaf Distelfeld博士領(lǐng)導(dǎo)的國際研究小組重建了野生小麥Triticum turgidum的基因組,該小麥是世界上幾乎所有馴化小麥的原始形式。
小麥是奠基作物之一,有可能在 10,000多年前促使新石器時代過渡到肥沃新月的農(nóng)業(yè)社會。
其馴化導(dǎo)致性狀發(fā)生變化,這主要與種子休眠,穗形態(tài)和籽粒發(fā)育有關(guān)。
例如,雖然野生小麥的穗狀花序在成熟時會破碎,但所有馴化的小麥穗狀花序仍保持完整,這使收割更加容易。
Distelfeld博士說:“從生物學(xué)和歷史的角度來看,我們創(chuàng)建了一個“時間隧道”,可以用來檢查農(nóng)業(yè)起源之前的小麥。”
為了重建小麥小麥的14條染色體,Distelfeld博士及其合作者使用了3D基因測序數(shù)據(jù)和軟件。
“與其他大多數(shù)農(nóng)作物相比,小麥的基因組要復(fù)雜得多,其基因組是人類基因組大小的三倍,”合著者,以色列NRGene公司首席執(zhí)行官吉爾·羅寧博士說。
“不過,我們開發(fā)的計算技術(shù)使我們能夠快速組裝野生小麥的14條染色體中發(fā)現(xiàn)的非常大而復(fù)雜的基因組,使其達到基因組研究從未達到的標準。”
薩斯喀徹溫大學(xué)的合著者Curtis Pozniak博士補充說:“我們?nèi)绱搜杆俚禺a(chǎn)生野生小麥基因組序列的能力是基因組研究的一大進步。”
“小麥幾乎占人類消耗的熱量的20%,因此,對提高小麥的產(chǎn)量和質(zhì)量的高度重視對我們未來的糧食供應(yīng)至關(guān)重要。”
為了了解進化到非破碎狀態(tài)的潛在遺傳變化,研究人員將負責馴化小麥破碎的基因與野生小麥的相應(yīng)基因進行了比較。
他們在馴化的小麥中鑒定了兩個失去功能的基因簇。
當他們用恢復(fù)了這些基因簇之一的小麥菌株進行工程改造時,小麥表現(xiàn)出獨特的尖峰,其上部是脆性的,而下部是不脆性的。
這些結(jié)果表明,這兩個基因簇在轉(zhuǎn)化野生小麥的脆性中起作用。
Distelfeld博士說:“我們與現(xiàn)代小麥的比較使我們能夠鑒定出允許馴化的精確基因-從野生種小麥過渡到現(xiàn)代品種。”
“雖然野生小麥的種子很容易從植物上掉下來并散落開來,但兩個基因的變化意味著在馴化的小麥中,種子仍然附著在莖上;正是這種特性使人類能夠收獲小麥。”
特拉維夫大學(xué)的合著者丹尼爾·查莫維茨博士說:“這項研究是公共和私人實體之間的協(xié)同合作伙伴關(guān)系。”
“最終,這項研究將對全球糧食安全產(chǎn)生重大影響。”
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