科學(xué)家繪制了病原真菌中的性染色體進(jìn)化圖
從生物學(xué)角度來說,地球上幾乎每個(gè)物種都有兩個(gè)異性,男性和女性。但是對(duì)于一些真菌和其他微生物,性可能會(huì)復(fù)雜得多。隱球菌屬的一些成員,一種與人類疾病相關(guān)的真菌,可以有數(shù)萬種不同的交配類型。
在8月11日早些時(shí)候在線發(fā)表于PLOS Biology的一項(xiàng)研究中,杜克大學(xué)的研究人員繪制了進(jìn)化轉(zhuǎn)折點(diǎn),將隱球菌的致病形式從許多性別的生物體轉(zhuǎn)變?yōu)橹挥袃煞N生物體的生物體。他們發(fā)現(xiàn),在進(jìn)化過程中,稱為易位的DNA的重新組合將單獨(dú)的性別決定基因塊整合到單個(gè)染色體上,基本上模仿人類X或Y染色體。
令人驚訝的是,他們已經(jīng)證明這些重要的易位發(fā)生在著絲粒上,這種扭曲的關(guān)系將染色體固定在x形對(duì)的中心。染色體的這些區(qū)域非常致密,以至于它們?cè)徽J(rèn)為是從重組中去除的。
“著絲粒的重組不必頻繁發(fā)生,它必須經(jīng)常發(fā)生以至于它突破了生物體的進(jìn)化,”Joseph Heitman博士說,他是高級(jí)研究作者,分子遺傳學(xué)和微生物學(xué)教授兼教授。杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院。“隨著每次易位,基因組會(huì)一次又一次地被改變,直到你進(jìn)化出一種全新的物種。”
一個(gè)多世紀(jì)以來,科學(xué)家一直在研究性染色體的進(jìn)化。在20世紀(jì)60年代,日裔美國(guó)遺傳學(xué)家和進(jìn)化生物學(xué)家Susumu Ohno提出了一種理論,其中決定性的基因首先出現(xiàn)在分散在整個(gè)基因組中的各個(gè)點(diǎn)上,但隨著時(shí)間的推移被“捕獲”在性染色體上。在人類中,那些染色體通過熟悉的X和Y;在鳥類中,它們被稱為Z和W;在苔蘚中,它們被稱為U和V.
無論名稱或物種如何,Heitman都認(rèn)為一些普遍原則可以控制所有性染色體的進(jìn)化。他和一個(gè)國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)專注于人類病原體新型隱球菌及其最近的同胞物種的最后一個(gè)共同祖先,這是一種叫做隱球菌(Cryptococcusamylolentus)的非病原體。
在C. amylolentus中,染色體上兩個(gè)不同位置的數(shù)十個(gè)基因控制著所謂的四極或四部分交配系統(tǒng)。在稱為P / R的一個(gè)位置或位點(diǎn),基因編碼信息素和信息素受體,幫助真菌識(shí)別相容的交配類型。在稱為HD的另一個(gè)基因座上,基因控制性結(jié)構(gòu)和生殖孢子的發(fā)育。
研究人員對(duì)C. amylolentus的整個(gè)基因組進(jìn)行了測(cè)序,繪制了所有基因的位置以及每個(gè)生物體14個(gè)染色體上的著絲粒。
他們發(fā)現(xiàn)基因組經(jīng)歷了相當(dāng)多的重排,因?yàn)檫@兩個(gè)物種至少在5000萬年前共有一個(gè)共同的祖先。例如,新生隱球菌的1號(hào)染色體包含來自C. amylolentus的4種不同染色體的片段,提供了多個(gè)易位的證據(jù),其中一些位于著絲粒內(nèi)。
“這非常令人驚訝。教條一直是重組在著絲粒區(qū)域被抑制,”杜克大學(xué)醫(yī)學(xué)院首席研究作者和助理研究教授孫勝博士說。
在20世紀(jì)80年代,杜克同事湯姆·皮特斯(Tom Petes)的一篇開創(chuàng)性論文表明,釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的著絲??赡軙?huì)發(fā)生重組,但有些人將這一發(fā)現(xiàn)歸結(jié)為偏愛的模型生物體的怪癖,其微小的點(diǎn)著絲粒。但從那以后,其他研究已經(jīng)出現(xiàn),表明這種現(xiàn)象的傳播范圍更廣。
在這項(xiàng)研究中,研究人員表明,在祖先的隱孢子蟲中,P / R基因座位于10號(hào)染色體上,而HD基因座位于11號(hào)染色體上。但在新生隱球菌這一進(jìn)化狀態(tài)中,這些基因座最終位于一個(gè)地方。根據(jù)他們的模型,多個(gè)易位將兩個(gè)性決定因子沉積在同一染色體上,其間有一個(gè)著絲粒。隨后的重新安排使P / R和HD彼此相鄰。結(jié)果是一個(gè)具有雙極交配系統(tǒng)的生物體,很像體現(xiàn)大多數(shù)物種的雄性和雌性。
“在這樣的任何一種模式中,你都在考慮最后一個(gè)共同祖先的組織可能是什么,現(xiàn)在已經(jīng)滅絕,所以你無法明確地知道,”海特曼說。“但是在這些譜系的每一個(gè)中,都會(huì)發(fā)生多個(gè)進(jìn)化事件,你可以使用基因組學(xué)來扭轉(zhuǎn)時(shí)間并推斷出軌跡。”
Heitman說,他們的研究表明,其他研究人員應(yīng)該積極尋找易位,無論是在預(yù)期位置還是在著絲粒內(nèi)。這些染色體重排是人類出生缺陷和癌癥的常見原因。
他和他的同事目前正在調(diào)查其他真菌家族(如Ustilago和Malassezia)的性染色體的進(jìn)化是否發(fā)生了類似的易位。
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