晶體結構揭示了非標準RNA轉錄的細節(jié)
高分辨率晶體結構揭示了在非傳統(tǒng)轉錄形式期間RNA的新途徑 - 從DNA模板產(chǎn)生RNA的過程。在重復轉錄過程中捕獲，這是一種轉錄形式，其中單個DNA堿基(由字母A，T，C和G表示)編碼RNA中的幾個相應堿基(DNA中的一個G導致幾個Gs)例如，在RNA中，新的晶體結構揭示了通過替代通道離開聚合酶的RNA，以實現(xiàn)這種非傳統(tǒng)的轉錄模式。賓夕法尼亞州立大學和阿拉巴馬大學伯明翰分校的一組研究人員發(fā)表的一篇論文發(fā)表在“美國國家科學院院刊”上。
“在X射線晶體學的經(jīng)典觀點中，你會認為酶-RNA聚合酶將被滅活，我們無法在結晶狀態(tài)下捕獲生化過程，”生物化學教授Katsuhiko S. Murakami說。和賓夕法尼亞州的分子生物學和該論文的作者。“但在包括我們在內的一些系統(tǒng)中，RNA聚合酶仍然存在，因此我們可以在制造RNA的過程中監(jiān)測結構。”
20世紀60年代早期，賓夕法尼亞大學的校友和諾貝爾化學獎獲得者Paul Berg，斯坦福大學的Robert W.和Vivian K. Cahill教授，名譽教授在斯坦福大學發(fā)現(xiàn)了Reiterative轉錄。盡管將DNA序列準確地轉錄成RNA似乎是一個簡單的錯誤 - 當RNA鏈相對于聚合酶內部的DNA鏈滑動時發(fā)生重復轉錄 - 它在細胞中具有功能。重復轉錄在控制許多基因的基因表達中起著關鍵作用，但盡管有這一重要作用，其機制仍然是一個黑盒子。
“我們的工作擴展了我們對RNA轉錄中涉及的分子機制的靈活性的理解，”賓夕法尼亞州立大學研究助理兼該論文作者Vadim Molodtsov說。“通過在重復轉錄過程中捕獲RNA聚合酶的晶體結構，我們能夠確定RNA用于退出酶的新途徑。它不是通過門進入，而是偷偷溜出窗外。”
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