為什么我們要對(duì)加拿大標(biāo)志性物種的基因組進(jìn)行測(cè)序
去年,為了紀(jì)念加拿大誕辰150周年 - 并為未來(lái)150年加拿大研究卓越奠定基礎(chǔ) - 我國(guó)的一組科學(xué)家開始實(shí)施加拿大150測(cè)序計(jì)劃(CanSeq150)。
受到我們國(guó)家對(duì)最能塑造我們歷史的動(dòng)物的好奇心的推動(dòng),我們對(duì)加拿大海貍(加拿大海貍)的基因組 - 基因教學(xué)書進(jìn)行了測(cè)序,以及加拿大的百年紀(jì)念。我們還開始對(duì)其他34種物種進(jìn)行測(cè)序,包括加拿大周杰倫(Perisoreus canadensis)和加拿大ly((Lynx canadensis)。
我們的目標(biāo)是對(duì)加拿大和加拿大人重要的150種生物的基因組進(jìn)行測(cè)序。
我們正在接受研究人員提出的建議,這些研究人員提出了每個(gè)擬議生物體對(duì)加拿大具有歷史或重要意義的最佳案例隨著新物種的選擇,加拿大的基因組學(xué)企業(yè)(CGEn)將宣布其網(wǎng)站上選擇進(jìn)行全基因組測(cè)序的其他物種。
其中一些基因組將以允許我們開發(fā)和測(cè)試新技術(shù)或方法來(lái)分析基因序列的方式進(jìn)行測(cè)序。我們也希望通過(guò)更好地了解其他物種的基因組 - 我們自己 - 我們可以更好地了解自己和我們?cè)谧匀粴v史中的位置。
科學(xué)家們學(xué)習(xí)并教授狄奧多西·多布贊斯基20世紀(jì)著名的概念:“除了從進(jìn)化的角度來(lái)看,生物學(xué)中的任何事物都沒(méi)有意義。”
在21世紀(jì),由于基因組序列能夠?qū)崿F(xiàn)更好的生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究,我們可能會(huì)考慮更新Dobzhansky的洞察力,包括基因組序列和進(jìn)化。
CanSeq150方法以過(guò)去的經(jīng)驗(yàn)為基礎(chǔ),為新提交提供靈感。例如,當(dāng)嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)相關(guān)的冠狀病毒在2003年威脅加拿大人的健康時(shí),研究人員動(dòng)員了病毒基因組的序列,以幫助診斷和疫苗開發(fā)。
沒(méi)有鳥腦
我們現(xiàn)在正致力于生成Perisoreus Canadensis的基因組序列 - 加拿大周杰倫 - 可以作為其他研究的參考。(被稱為灰色杰伊60年,美國(guó)鳥類學(xué)家聯(lián)盟最近恢復(fù)了原來(lái)的名字。)
加拿大杰伊居住在所有13個(gè)省和地區(qū),并在第一民族民間傳說(shuō)中占據(jù)重要地位,稱為Wisakedjak或威士忌杰克。它被指定為加拿大國(guó)家鳥類的強(qiáng)烈支持。
加拿大杰伊的一個(gè)迷人特征是其出眾的智慧。它在廣泛分散的地點(diǎn)開發(fā)了一種高度復(fù)雜的食物儲(chǔ)存策略,使鳥類在冬季繁殖季節(jié)保持活力。每個(gè)加拿大杰伊每個(gè)季節(jié)都可以通過(guò)記憶和模式識(shí)別來(lái)檢索數(shù)以千計(jì)的唾液涂層食物緩存 - 所有這些都通過(guò)其大腦結(jié)構(gòu)硬連接并由其基因組編碼。
先天與后天
早在加拿大成為一個(gè)國(guó)家之前,哈德遜灣公司的早期會(huì)計(jì)分類賬顯示加拿大ly and和雪兔野兔處于專制關(guān)系。
這兩種動(dòng)物的地理范圍相同,覆蓋了加拿大北方森林。從歷史毛皮收獲記錄中推斷,野兔和lynx種群被發(fā)現(xiàn)在緊密相連的10年周期中振蕩。
ly and和野兔的基因組可以啟發(fā)研究人員如何改變環(huán)境誘導(dǎo)激素,并促進(jìn)野兔種群生殖適應(yīng)性的周期性下降。
將揭示編碼環(huán)境傳感器的遺傳變化,這些傳感器是雪鞋兔的季節(jié)性毛色變化的基礎(chǔ),以及其他生理和環(huán)境關(guān)系。
生活的代碼
基因組為整個(gè)生命體內(nèi)的發(fā)育的所有方面提供了類似藍(lán)圖或管弦樂(lè)得分的方向的細(xì)胞。
人類從父母那里繼承了一半的DNA,就像他們從父母那里繼承的那樣,依此類推,直接回到了智人的起源。嵌入在這種DNA中的基因組信息將查爾斯達(dá)爾文的數(shù)百萬(wàn)種物種聯(lián)系在一起。
我們有大量的例子證明解碼人類基因組如何能夠揭示癌癥和自閉癥等疾病和病癥的基礎(chǔ),并為早期檢測(cè)提供診斷。醫(yī)學(xué)或藥學(xué)治療越來(lái)越多地針對(duì)疾病的特定特征,例如細(xì)胞在其表面上表達(dá)的蛋白質(zhì)。
根據(jù)定義,基因組測(cè)序比早期技術(shù)提供了更好的基因組遺傳標(biāo)記覆蓋率。我們將對(duì)鯨魚和鱒魚,熊和綿羊,楓樹和真菌進(jìn)行測(cè)序,以發(fā)現(xiàn)基因組DNA條形碼 -覆蓋所有細(xì)胞染色體的DNA標(biāo)記 - 對(duì)選擇和適應(yīng)很重要,可用于育種和保護(hù)。
給科學(xué)的禮物
我告訴自己的學(xué)生,隨著基因組科學(xué)的一些應(yīng)用變得相當(dāng)輕松,我們現(xiàn)在只受到我們的創(chuàng)造力的限制。
為了鼓勵(lì)這種創(chuàng)造力,我們認(rèn)為研究特定新基因組序列的第一個(gè)裂縫應(yīng)該由最能了解該生物體獨(dú)特的生物,文化,經(jīng)濟(jì),社會(huì)和歷史作用的研究人員做出。
對(duì)于CanSeq150,我們將對(duì)加拿大研究人員提出的150種生物的基因組進(jìn)行測(cè)序。
我們相信這些科學(xué)家可以最好地利用我們國(guó)家和世界的基因組序列信息。
這些經(jīng)驗(yàn)將影響未來(lái)項(xiàng)目的決策,包括與人類疾病相關(guān)的項(xiàng)目。基因組計(jì)劃的典型成本為3,000美元,雖然這項(xiàng)費(fèi)用將由CGEn及其合作伙伴承擔(dān),但這些研究將由提交測(cè)序基因組的研究人員領(lǐng)導(dǎo)。
CanSeq150的結(jié)果將通過(guò)公共數(shù)據(jù)庫(kù)向全世界的研究人員提供,例如國(guó)家生物技術(shù)信息中心。
通過(guò)我們對(duì)Dobzhanksy進(jìn)化生物學(xué)概念的“更新”(基于基因組)的觀點(diǎn),我們渴望通過(guò)利他主義促進(jìn)科學(xué)發(fā)現(xiàn)。了解CanSeq150物種之間的交叉點(diǎn) - 以及其他物種 - 肯定會(huì)幫助我們成為我們傳統(tǒng)的明智監(jiān)護(hù)人。
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