跳躍基因協(xié)同工作以控制基因組中的程序性缺失
科學(xué)家們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一種新的分子家族,這種分子在單細胞淡水生物(稱為纖毛蟲)的繁殖過程中能夠精確地去除不需要的DNA。
這些新分子的發(fā)現(xiàn)對我們理解基因去除(或“切除”)和重排的機制具有深遠的意義,這些機制在許多物種的發(fā)育和進化中起著至關(guān)重要的作用。研究結(jié)果發(fā)表在eLife上。
轉(zhuǎn)座子是在基因組中移動的DNA片段,通過與其結(jié)合的稱為轉(zhuǎn)座酶的酶轉(zhuǎn)運。隨著轉(zhuǎn)座子在進化過程中跳躍,宿主生物可以獲得它們攜帶的基因并利用它們在稱為馴化的過程中獲得新的功能。
來自稱為PiggyBac的家族的轉(zhuǎn)座酶已經(jīng)多次被馴化在各種生物體中。雖然它們的功能知之甚少,但已知它們在纖毛蟲(如草履蟲)的繁殖中起著重要作用。
當(dāng)這些單細胞生物繁殖時,它們經(jīng)歷了巨大的基因組擴增并去除了相當(dāng)大比例的重復(fù)遺傳物質(zhì),包括轉(zhuǎn)座子。這包括精確切除45,000個非編碼DNA片段(稱為內(nèi)部消除序列),否則會中斷47%的基因組中所有基因。
“我們知道PiggyBac是PiggyBac家族中的馴化轉(zhuǎn)座酶,它負責(zé)切割DNA,但我們所不知道的是切除機制是如何精確定位在DNA末端的,”主要作者Julien Bischerour解釋道。法國巴黎薩克萊大學(xué)CNRS細胞整合生物學(xué)研究所研究員。
在這項研究中,研究小組確定了另外五組PiggyBac轉(zhuǎn)座酶家族,它們與PiggyMac一起準確刪除草履蟲基因組中的特定DNA片段。通過沉默不同的家養(yǎng)PiggyBac轉(zhuǎn)座酶,他們發(fā)現(xiàn)每個組都起著建筑作用,并且在繁殖和隨后的基因去除過程中PiggyMac向細胞核的運動是必不可少的。
此外,阻斷PiggyBac轉(zhuǎn)座酶的活性在去除過程中引起許多錯誤。這表明一些家庭成員保留了活動,但過程變得不那么有效和準確。它還揭示了這些分子切割的優(yōu)選DNA長度的見解。一些序列在機械上難以去除的事實揭示了在進化過程中草履蟲中基因缺失的潛在限制。
“我們發(fā)現(xiàn)新的PiggyMac合作伙伴,由草履蟲基因組中的五組重復(fù)基因編碼,通過轉(zhuǎn)座酶對這些非編碼序列的去除機制和對所涉及的機器的更深入了解帶來了新的見解,”資深作者MireilleBétermier解釋說,巴黎 - 薩克萊大學(xué)CNRS細胞綜合生物學(xué)研究所研究員。“根據(jù)我們的工作,未來對人類馴化轉(zhuǎn)座酶的研究應(yīng)考慮到這些分子可能在同一細胞功能中共同作用的可能性。”
推薦內(nèi)容
-
水母熒光為DNA復(fù)制帶來新的亮點
約克大學(xué)的科學(xué)家們使用了水母的熒光蛋白來幫助揭示DNA如何復(fù)制。使用最初在水母中發(fā)現(xiàn)的這些蛋白質(zhì)使它們發(fā)光,該團隊能夠?qū)⒓す馐劢乖?
-
研究人員展示了結(jié)合藥物控制寄生蟲的工程方法
實驗室視頻講述了這樣一個故事:在營養(yǎng)液中自由游動的微小寄生蟲是活躍的和可移動的;將同種蠕蟲暴露于通過工程技術(shù)優(yōu)化的四種藥物的混合物
-
研究人員發(fā)現(xiàn)了DNA損傷控制背后的機制
由于外部因素(如暴露在陽光下)或內(nèi)部因子(如活性氧),我們的細胞一直在發(fā)生DNA損傷。為了檢測和修復(fù)DNA損傷,細胞已經(jīng)進化出DNA損傷反應(yīng)。
-
科學(xué)家設(shè)計出能夠克服對常規(guī)抗生素耐藥性的新分子
由西班牙國家研究委員會(CSIC)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個小組在對抗超級細菌及其對多種藥物的抵抗力方面取得了重大突破??茖W(xué)家設(shè)計的分子可以打
-
來自媽媽的遺傳指示為胚胎發(fā)育設(shè)定了模式
一項新的研究表明母系遺傳基因在胚胎發(fā)育中的重要作用。該研究發(fā)現(xiàn),未能從母親遺傳特定遺傳指令的斑馬魚在發(fā)育早期就會發(fā)生致命缺陷,...
-
FDA批準使用實驗性血液測試進行Zika篩查
聯(lián)邦衛(wèi)生官員正允許使用實驗性血液測試來篩查Zika病毒,這是一項緊急步驟,旨在保護本地血液供應(yīng)免遭蚊媒病毒的侵害。這項行動意味著活躍寨
-
離子通道的結(jié)構(gòu)揭示了昆蟲如何聞到世界各地
蚊子,暴露的腳踝和肘部的死敵,使用精細調(diào)整的嗅覺定位每個血腥的膳食。然而,并非所有的昆蟲都可以嗅出脆弱的肉體。例如,蝴蝶不是在...
-
新技術(shù)繪制了人體腸道中糖降解細菌的基因組圖譜
生物信息學(xué)1中報道的一種新設(shè)計的計算機工具可以自動識別人腸道細菌中特定的酶編碼基因位點。這種基因位點稱為多糖利用基因座(PUL),它編碼
-
三種生物染色質(zhì)組織的比較分析
ENCODE于2003年推出,用于破譯人類基因組中存在的不同基因組元素。大規(guī)模努力的目標之一是了解基因表達調(diào)控的表觀遺傳作用。該項目研究了染
-
國際研究有助于確定GAMOS治療的途徑
對蛋白質(zhì)復(fù)合物KEOPS的新研究表明GAMOS基因編碼中存在特定的突變,這是一種導(dǎo)致發(fā)育和身體異常的嚴重遺傳疾病1。GAMOS表現(xiàn)為腎病綜合征,一