扭曲拉伸的DNA可能會增加CRISPR-Cas9脫靶變化的風險
一項新的研究表明,當使用CRISPR-Cas9時,在基因表達和其他細胞過程中常規(guī)發(fā)生的對DNA的扭曲可導(dǎo)致基因組的脫靶變化。該研究背后的醫(yī)學研究委員會科學家表示,他們的研究結(jié)果可能有助于為臨床應(yīng)用提高基因編輯的準確性鋪平道路。
在基因表達過程中,DNA被拉伸并扭曲成其通常的形狀。雖然這對于細胞自身機器的正常功能是必需的,但它可能通過增加脫靶編輯的風險對CRISPR-Cas9基因編輯構(gòu)成挑戰(zhàn),可能引入有害的變化。來自MRC倫敦醫(yī)學科學和阿斯利康的科學家的研究結(jié)果發(fā)表于今天的自然結(jié)構(gòu)和分子生物學期刊。
CRISPR-Cas9是一種基因編輯工具,允許研究人員發(fā)現(xiàn)和編輯DNA鏈,因其科學家在醫(yī)學,藥物發(fā)現(xiàn)和農(nóng)業(yè)等多個領(lǐng)域使用該技術(shù)而在眾多目的中獲得了全世界的認可。
在這項研究中,使用一種新方法研究了CRISPR-Cas9的準確度和精確度:科學家使用光學鑷子 - 一種利用激光束操縱DNA的工具 - 模仿DNA自然經(jīng)過的扭曲,因為細胞的機器讀取了它。然后他們使用CRISPR-Cas9編輯基因并使用熒光顯微鏡監(jiān)測其準確性。
結(jié)果表明,當DNA松散和松弛時,CRISPR是準確的。但是當發(fā)生扭曲時 - 在這種情況下,由于高度拉伸 - 精度降低,并且觀察到脫靶編輯。了解這種效應(yīng)將有助于設(shè)計具有更高準確度的CRISPR系統(tǒng),以及評估此風險的方法。
研究的主要作者,MRC LMS和倫敦帝國理工學院的David Rueda教授說:“CRISPR-Cas9作為一種有助于預(yù)防或?qū)褂蒁NA突變引起的疾病的潛在工具而備受矚目,我們想研究它的準確性。當我們操縱DNA結(jié)構(gòu),模仿DNA經(jīng)歷的自然扭曲時,我們發(fā)現(xiàn)對非預(yù)期的位點進行了編輯。在這種情況下,CRISPR-Cas9在靶向系統(tǒng)中可能顯示多達50%的錯配,這將是使用它的一個問題。臨床環(huán)境中的基因編輯工具。
“另一方面,非常積極的是我們開發(fā)了一個系統(tǒng),可以清楚地對CRISPR-Cas9成像,因此我們可以研究錯誤發(fā)生的原因,并調(diào)整技術(shù)以提高準確性和特異性。”
AstraZeneca發(fā)現(xiàn)科學副主任Emanuela Cuomo博士說:“在阿斯利康,我們正在努力了解CRISPR的作用機制,使我們能夠為將來的研究和潛在治療目的設(shè)計改良的酶。我們學習了CRISPR-Cas9,并強調(diào)了未來的探索領(lǐng)域,以便更好地理解DNA結(jié)構(gòu)與脫靶效應(yīng)之間的關(guān)系。“
MRC的遺傳學,表觀遺傳學和基因組學項目經(jīng)理Lindsay Wilson博士說:“這項研究至關(guān)重要,因為它有助于我們了解使用CRISPR的風險,例如編輯人體細胞。最終可能導(dǎo)致策略MRC也支持使用基因組編輯進行科學和道德嚴格的實驗室研究,包括研究以了解技術(shù)風險和限制,以及解決這些問題的步驟。
科學家表示他們接下來的步驟是確定他們?nèi)绾文軌驕p少意外編輯的機會。他們計劃使用他們的新系統(tǒng)進一步研究CRISPR的準確性,并且理想情況下,根據(jù)他們的發(fā)現(xiàn)開發(fā)脫靶預(yù)測算法。
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