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      大象內(nèi)皮皰疹病毒4的完整基因組測序
      
			
      
				2019-01-19 11:13:38
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      大象內(nèi)皮藥物皰疹病毒4的完整基因組，稱為EEHV4(Baylor)，已被貝勒醫(yī)學院和約翰霍普金斯醫(yī)學院的研究人員測序，揭示了這種特殊種類的大象內(nèi)皮皰疹病毒的獨特特征 - 這導致了致命的在管理式護理和自由放養(yǎng)環(huán)境中影響亞洲大象的疾病。
      

      大象內(nèi)皮皰疹病毒4的完整基因組測序
      

      該研究結果發(fā)表在美國微生物學會的mSphere當前版本中。“這種疾病的致命形式主要與EEHV1有關，但是更溫和的疾病是由EEHV5或EEHV4引起的，其中已知的較少，”貝勒博士分子病毒學和微生物學副教授Paul Ling博士說。“在這里，我們已經(jīng)確定了完整的基因組DNA序列，由Baylor的人類基因組測序中心完成，這是一種EEHV4物種，它是從患有EEHV4后從幸存的亞洲象小牛采集的樹干洗滌樣本中獲得的。”
      

      這只特殊的小牛是休斯頓動物園受監(jiān)測群體的一部分，該動物園受益于動物園，貝勒，約翰霍普金斯和華盛頓國家動物園之間的研究合作，研究EEHV。該團隊開發(fā)了一種快速診斷測試，可以定期進行血液和軀干清洗。
      

      由于這些篩查，研究人員發(fā)現(xiàn)，牛群中的一些大象經(jīng)歷了不同種類的EEHV(包括EEHV4)的連續(xù)輕度感染。“很可能牛群最終會感染多種EEHV物種和亞型，因此了解分子組成并更多地了解不同物種之間的遺傳關系將提供可能導致控制疾病的信息，”Ling說。
      

      研究人員已經(jīng)對EEHV1A，EEHV1B和EEHV5進行了測序。在EEHV4(Baylor)中，他們發(fā)現(xiàn)了25個新的或缺失的基因 - 一些存在于EEHV4(Baylor)中但不存在于其他基因中，以及存在于其他基因中但在EEHV4(Baylor)中缺失的基因。
      

      鑒定的另一個特征是存在26個旁系同源的跨膜蛋白家族的旁系同源物(來自同一基因)成員。有關這些發(fā)現(xiàn)的更詳細描述可以在隨附的手稿中找到，該手稿目前也在mSphere中發(fā)布。
      

      研究人員還能夠確定這種病毒物種的兩種不同亞型的存在，稱為EEHV4A和EEHV4B。
      

      “仍然存在圍繞EEHV致病性的問題，需要更多的研究，”約翰霍普金斯大學醫(yī)學院的Gary S. Hayward博士說。“一旦更好地理解了許多物種及其各自亞型的發(fā)病機制差異，所有基因組類型的序列和基因內(nèi)容的詳細比較將有望為將來的診斷，評估和潛在的疫苗或抗病毒診斷方法提供重要和有用的信息。 ，治療和控制EEHV相關疾病。“
      

      這是該組測序的第二個完整的EEHV基因組，另一個是2013年的EEHV1A(Kimba)。
      

      參與這項研究的其他人包括：Simon Y. Long，Sarah Y. Heaggans，以及約翰霍普金斯大學醫(yī)學院; Angela Fuery，彭榮生，貝勒醫(yī)學院; Xiang Qin，Kim C. Worley，Shannon Dugan，
      
			

			
        
      
			
      
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