新的基因工程技術(shù)可以幫助設(shè)計 研究生物系統(tǒng)
一項新技術(shù)將幫助生物學(xué)家修補基因,無論目標(biāo)是將細胞轉(zhuǎn)變?yōu)樯a(chǎn)藥物的小工廠,修改作物以在有限的水中生長,還是研究基因?qū)θ祟惤】档挠绊憽T摷夹g(shù)于1月20日在Nature Communications上發(fā)表,它允許科學(xué)家精確調(diào)節(jié)特定基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)含量。這個過程簡單而富有創(chuàng)新性,到目前為止,從細菌到植物再到人體細胞都可以發(fā)揮作用。
“基本上,這是修改基因表達的通用工具包,”華盛頓大學(xué)圣路易斯醫(yī)學(xué)院細胞生物學(xué)和生理學(xué)助理教授,該研究的資深作者Sergej Djuranovic博士說。“無論您是通過基因工程細胞生產(chǎn)特定的有機分子,還是研究基因的工作原理,它都可以使用。”
控制特定基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)量的能力對于設(shè)計或重新設(shè)計生物系統(tǒng)的生物學(xué)家(例如構(gòu)成細胞代謝的一組生化反應(yīng))來生產(chǎn)所需產(chǎn)品是一種福音。例如,一些藥物 - 包括抗生素如萬古霉素和抗癌藥物如紫杉醇 - 是由細胞產(chǎn)生的新陳代謝副產(chǎn)物。通過微調(diào)某些基因,生物學(xué)家可以最大化生產(chǎn)的藥物數(shù)量。
Djuranovic本人對調(diào)節(jié)基因表達以研究疾病相關(guān)基因感興趣,例如與癌癥有關(guān)的基因。
“有各種各樣的復(fù)雜疾病,如癌癥和自閉癥,我們知道特定基因的表達被調(diào)低,但沒有人知道這種減少是如何導(dǎo)致這種疾病的,”Djuranovic說。“對于經(jīng)典遺傳學(xué),你只能研究當(dāng)你有兩個拷貝,一個拷貝或沒有拷貝基因時,或者換句話說,100%,50%或零百分比的基因表達時會發(fā)生什么?,F(xiàn)在我們可以看看它們之間的一切“。
該技術(shù)利用細胞過程中稱為mRNA翻譯的特征,這是從DNA產(chǎn)生蛋白質(zhì)的關(guān)鍵步驟。為了制造蛋白質(zhì),首先將基因復(fù)制到稱為信使RNA的相關(guān)分子中,然后將其翻譯成蛋白質(zhì)。
信使RNA是具有四種連接的長分子鏈 - 腺嘌呤(A),胞嘧啶(C),鳥嘌呤(G)和尿嘧啶(U)。一般來說,這些鏈接是混合在一起的,就像單詞中的字母一樣,但有時很多A會連續(xù)出現(xiàn)。這樣的序列很滑; 將RNA翻譯成蛋白質(zhì)的分子機制有一種趨勢,即在A到達終點之前在A的長軌道上停止和滑動,從而減少產(chǎn)生的蛋白質(zhì)的量。
Djuranovic,研究生Laura Arthur及其同事表明,A字符串的光滑性可用于調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)含量。它們添加到一條信使RNA的起點或中間的A越多,從它產(chǎn)生的蛋白質(zhì)就越少。通過仔細控制A弦的長度,或在弦的某個位置引入不同的分子鏈,它們可以產(chǎn)生他們想要的蛋白質(zhì)。
Djuranovic及其同事在細菌,原生動物,酵母,植物,果蠅,小鼠和人類細胞中測試了這項技術(shù)。它在所有這些生物體中起作用,因為RNA翻譯是一種進化上古老的過程,在所有生命形態(tài)中都以相同的方式發(fā)生。
“關(guān)于這一點的好處是它有多么簡單,”Djuranovic說。“過去,如果你想要一個能夠?qū)⒒虮磉_降低30%的突變,那么需要多年的工作和很多運氣才能找到這樣的基因。現(xiàn)在我們可以在幾天內(nèi)完成。”
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