科學(xué)家為古菌改善進(jìn)化生命之樹
來(lái)自英國(guó),法國(guó),匈牙利和瑞典的一個(gè)國(guó)際研究小組為古細(xì)菌的起源提供了新的見解,古細(xì)菌是一種簡(jiǎn)單的細(xì)胞生物,是所有復(fù)雜生命的祖先。
該古是細(xì)胞生命的主要領(lǐng)域之一,并可能有生命的最古老的形式:在疊層石太古細(xì)胞的推測(cè)化石已經(jīng)近35十億年前追溯到。
與細(xì)菌一樣,這些微生物是原核生物,這意味著它們的細(xì)胞中沒有細(xì)胞核或任何其他細(xì)胞器。
它們?cè)诹钊搜刍潄y的各種棲息地中茁壯成長(zhǎng),從熟悉的土壤和海洋到令人生畏和奇異的棲息地。
它們?cè)诂F(xiàn)代生物地球化學(xué)循環(huán)中發(fā)揮著重要作用,并且是關(guān)于真核細(xì)胞起源的爭(zhēng)論的核心。然而,由于涉及巨大的時(shí)間跨度,了解它們的起源和進(jìn)化歷史具有挑戰(zhàn)性。
為了找到古菌樹的根,并解決最早的古菌細(xì)胞的新陳代謝,布里斯托大學(xué)的研究員湯姆威廉姆斯博士和合著者應(yīng)用了一種新的統(tǒng)計(jì)方法,利用基因家族進(jìn)化模式中的信息。
威廉姆斯博士說(shuō):“隨著直接從環(huán)境中測(cè)序基因組的新技術(shù)的發(fā)展,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多新的古菌群。”
“雖然這些基因組大大提高了我們對(duì)古菌多樣性的理解,但迄今為止它們未能使該群體的進(jìn)化歷史變得清晰。”
“這是因?yàn)?,與其他微生物一樣,古菌經(jīng)常通過(guò)側(cè)向基因轉(zhuǎn)移從遠(yuǎn)緣相關(guān)生物中獲得DNA,這可能使進(jìn)化史的重建變得極為復(fù)雜。”
通過(guò)確定哪些基因首先出現(xiàn)在古細(xì)菌的進(jìn)化過(guò)程中,新的進(jìn)化樹對(duì)最早的古細(xì)菌的基本生物化學(xué)作出了明確的預(yù)測(cè),這些細(xì)胞可能已經(jīng)存在于35億年前。
“有根的樹上的代謝重建表明,早期的古菌是厭氧菌,可能通過(guò)Wood-Ljungdahl途徑將二氧化碳減少為乙酸鹽,這種生化途徑不僅存在于古細(xì)菌中,而且還存在于細(xì)菌中,另一種主要的微生物群,“作者說(shuō)。
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