用于檢測(cè)腫瘤中不同癌細(xì)胞的新計(jì)算機(jī)模型
一組科學(xué)家設(shè)計(jì)了一種新的基于計(jì)算機(jī)的統(tǒng)計(jì)模型,能夠檢測(cè)腫瘤內(nèi)癌細(xì)胞的亞型。
惡性腫瘤可包含具有不同突變基因組的不同亞型的癌細(xì)胞。然而,大多數(shù)現(xiàn)有的基于計(jì)算機(jī)的模型,通常假設(shè)腫瘤僅由一種類型的癌細(xì)胞構(gòu)成,未能檢測(cè)到可能潛在生長(zhǎng)甚至逃避化學(xué)治療的其他亞型。
發(fā)表在Bioinformatics1上的國(guó)際研究小組的新模型現(xiàn)在可以通過研究基因表達(dá)來估計(jì)和分類個(gè)體腫瘤中每種癌細(xì)胞亞型的分?jǐn)?shù)。首席研究員帕特里克弗萊厄蒂說:“這種模式可能對(duì)醫(yī)生推薦一種能夠針對(duì)腫瘤中癌細(xì)胞的所有亞型而不僅僅是多數(shù)亞型的聯(lián)合化療有用。”
被稱為Gaussian-Laplace-Dirichlet(GLAD)模型的美國(guó)伍斯特理工學(xué)院和摩洛哥Al Akhawayn大學(xué)的研究人員首先將其用于計(jì)算機(jī)生成的腫瘤數(shù)據(jù),其中兩種亞型的癌細(xì)胞表達(dá)500種基因,模型成功檢測(cè)到不同的癌細(xì)胞亞型。
通過檢測(cè)組織特異性基因表達(dá),它還能夠?qū)碜源笫蟮母危魏湍X組織的混合群體進(jìn)行分類。當(dāng)應(yīng)用于來自包含四種亞型(經(jīng)典,胸膜,神經(jīng)和間充質(zhì))癌細(xì)胞的原發(fā)性腦腫瘤的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)時(shí),該模型也成功。
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