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      健壯的SNP條形碼可對(duì)結(jié)核病復(fù)雜菌株進(jìn)行基因分型
      
			
      
				2018-12-03 13:06:03
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      結(jié)核病是由有彈性的細(xì)菌病原體結(jié)核分枝桿菌和其他分枝桿菌物種引起的，統(tǒng)稱為結(jié)核分枝桿菌復(fù)合體(MTBC)。結(jié)核病的臨床表現(xiàn)范圍從肺病到神經(jīng)系統(tǒng)，淋巴系統(tǒng)或骨骼和關(guān)節(jié)的感染，并且它取決于致病MTBC病原體的菌株。
      

      健壯的SNP條形碼可對(duì)結(jié)核病復(fù)雜菌株進(jìn)行基因分型
      

      不同的菌株來自病原體基因組中DNA核苷酸序列的變化?，F(xiàn)在，來自英國，葡萄牙和沙特阿拉伯的一組研究人員提出了一種基于所謂的單核苷酸多態(tài)性(SNP)識(shí)別不同MTBC菌株的系統(tǒng)1。
      

      通過測序和比較來自1,601個(gè)MTBC病原體群體的基因組，他們發(fā)現(xiàn)了大約92,000個(gè)SNP，其中7,000個(gè)是菌株特異性的。
      

      從這些中，他們尋找穩(wěn)健的SNP - 不太可能發(fā)生基因突變的穩(wěn)定SNP - 并提出了一套62種遺傳標(biāo)記，或“條形碼”，對(duì)常見的TB菌株進(jìn)行基因分型。
      

      他們通過在代表所有MTBC菌株的27個(gè)已知基因組上測試它們來驗(yàn)證他們選擇的標(biāo)記集。該組區(qū)分不同菌株的能力為100%。
      

      能夠識(shí)別導(dǎo)致患者感染的菌株可以幫助指導(dǎo)進(jìn)行治療策略，并且是開發(fā)疫苗的重要知識(shí)。
      
			

			
        
      
			
      
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