新的研究發(fā)現(xiàn)，抗生素耐藥的肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是一種可引起人類呼吸道和血流感染的機(jī)會性病原體，正在歐洲的醫(yī)院中傳播。某些肺炎克雷伯菌菌株對碳青霉烯類抗生素具有耐藥性，這些抗生素代表了治療感染的最后一道防線，因此被認(rèn)為具有極強的耐藥性(XDR)。

在歐洲范圍內(nèi)對腸桿菌科細(xì)菌的調(diào)查中，位于弗萊堡大學(xué)惠康桑格研究所的基因組病原體監(jiān)測中心及其合作伙伴的研究人員分析了從患者身上采集的近2000個肺炎克雷伯氏菌樣本的基因組。32個國家的244家醫(yī)院。今天(2019年7月29日)在“ 自然微生物學(xué)”雜志上發(fā)表的研究結(jié)果將為公共衛(wèi)生工作提供信息，以控制這些感染在歐洲各地醫(yī)院的傳播。

據(jù)估計，2007年歐洲有341例死于碳青霉烯類耐藥肺炎克雷伯菌 ; 到2015年，死亡人數(shù)增加了六倍，達(dá)到2,094人。大量死亡的原因是，一旦碳青霉烯不再有效對抗抗生素抗性細(xì)菌，就沒有其他選擇了。嬰兒，老年人和免疫受損的人尤其處于危險之中。

該調(diào)查是同類調(diào)查中規(guī)模最大的調(diào)查，也是歐洲持續(xù)監(jiān)測碳青霉烯類耐藥細(xì)菌的第一步。從244家醫(yī)院的患者中收集了2000多份肺炎克雷伯菌樣本，并送到惠康桑格研究所，對其中1,700個基因組進(jìn)行了測序。

研究人員發(fā)現(xiàn)了少數(shù)幾種基因，這些基因在表達(dá)后會對碳青霉烯類抗生素產(chǎn)生耐藥性。這些基因產(chǎn)生稱為碳青霉烯酶的酶，它們“咀嚼”抗生素，使它們變得無用。

最令人擔(dān)憂的是，最近出現(xiàn)了少量攜帶一種或多種碳青霉烯酶基因的“高風(fēng)險”克隆，這些基因已迅速傳播。據(jù)認(rèn)為，醫(yī)院中大量使用抗生素有利于這些高抗性細(xì)菌的傳播，這些細(xì)菌勝過其他易于用抗生素治療的菌株。

該研究的第一作者索菲亞大衛(wèi)博士在基因組病原體監(jiān)測中心表示：“抗生素抗性的'一種健康'***方法著重于病原體通過人類，動物和環(huán)境的傳播，包括但對于碳青霉烯類耐藥性肺炎克雷伯菌，我們的研究結(jié)果意味著醫(yī)院是傳播的關(guān)鍵促進(jìn)因素 - 超過一半攜帶碳青霉烯酶基因的樣本與從同一家醫(yī)院收集的其他樣本密切相關(guān)，這表明細(xì)菌正在傳播主要是在醫(yī)院內(nèi)的人與人之間。“

抗生素抗性細(xì)菌樣本也更可能與同一國家不同醫(yī)院的樣本密切相關(guān)，而不是跨國家 - 這表明國家醫(yī)療系統(tǒng)作為一個整體在這些抗生素耐藥細(xì)菌的傳播中發(fā)揮重要作用。

盡管碳青霉烯類耐藥性肺炎克雷伯菌對患者構(gòu)成了明顯的威脅，但醫(yī)院中更有效的感染控制，包括考慮患者如何在醫(yī)院之間移動和衛(wèi)生干預(yù)，將產(chǎn)生影響。

弗萊堡大學(xué)醫(yī)學(xué)中心共同主要作者兼感染預(yù)防和醫(yī)院衛(wèi)生研究所所長Hajo Grundmann教授說：“我們樂觀地認(rèn)為，良好的醫(yī)院衛(wèi)生，包括早期識別和隔離攜帶這些疾病的患者細(xì)菌，我們不僅可以延緩這些病原體的傳播，而且還可以成功地控制它們。本研究強調(diào)了感染控制和抗生素耐藥菌的持續(xù)基因組監(jiān)測的重要性，以確保我們及早發(fā)現(xiàn)新的耐藥菌株并采取行動對抗這種傳播。抗生素耐藥性。“

目前正計劃對歐洲各醫(yī)院的腸桿菌科細(xì)菌家族進(jìn)行第二次調(diào)查。生成的數(shù)據(jù)可通過MicroReact獲得，MicroReact是由基因組病原體監(jiān)測中心開發(fā)的公開可用的基于網(wǎng)絡(luò)的工具。MicroReact將幫助研究人員和醫(yī)療保健系統(tǒng)繪制肺炎克雷伯菌等病原體的抗生素耐藥性，并監(jiān)測它們?nèi)绾芜M(jìn)化。

共同主要作者兼基因組病原體監(jiān)測中心主任David Aanensen教授說：“基因組監(jiān)測將是解決這項研究已經(jīng)確定的新抗生素抗性病原菌株的關(guān)鍵。目前，新菌株正在發(fā)展盡可能快地對它們進(jìn)行排序。建立健全的基因組測序中心網(wǎng)絡(luò)的目標(biāo)將使醫(yī)療保健系統(tǒng)能夠更快地跟蹤這些細(xì)菌的傳播以及它們?nèi)绾伟l(fā)展。