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      了解甘薯用蛋白質(zhì)組學(xué)方法
      
			
      
				2019-06-20 09:14:41
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      甜，淀粉，橙色甘薯是薯條，砂鍋和餡餅的美味和營養(yǎng)成分。但是，盡管人類幾千年來一直在種植甘薯，但科學(xué)家對蛋白質(zhì)的構(gòu)成仍然知之甚少。最近在ACS的蛋白質(zhì)組研究雜志上發(fā)表的一項研究中，科學(xué)家分析了甘薯葉片和根的蛋白質(zhì)組，并在此過程中揭示了植物基因組的見解。
      

      了解甘薯用蛋白質(zhì)組學(xué)方法
      

      甘薯(Ipomoea batatas)是世界上一些地區(qū)的主食。它也常用于動物飼料以及工業(yè)產(chǎn)品，如生物燃料。它的基因組令人驚訝地復(fù)雜 - 編碼比人類基因組更多的預(yù)測基因 - 它具有復(fù)雜的化學(xué)成分。
      

      該團隊使用兩種不同的方法從根和葉樣品中提取蛋白質(zhì)，然后將其切割成多肽。然后用液相色譜和質(zhì)譜分析樣品，研究小組在甘薯葉中鑒定出3,143種獨特蛋白，在根中鑒定出2,928種。甘薯的根(我們吃的部分)具有低蛋白質(zhì)含量，并且葉子具有許多次級代謝物。這使得提取足夠量的蛋白質(zhì)用于分析變得困難。密西西比州立大學(xué)的Sorina和George Popescu及其同事希望了解蛋白質(zhì)組學(xué)方法 - 同時分析蛋白質(zhì)和遺傳數(shù)據(jù) - 可以幫助他們更好地了解甘薯根和葉的成分。
      

      當(dāng)他們將蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)與甘薯基因組進行比較時，他們確定了已發(fā)表的基因組序列的某些區(qū)域，其數(shù)據(jù)可以為其提供增強的信息。例如，該分析預(yù)測了741個新的蛋白質(zhì)編碼區(qū)域，這些區(qū)域以前不被認(rèn)為是基因。
      

      該組織表示，該結(jié)果可用于幫助進一步表征和生物強化塊莖。
      
			

			
        
      
			
      
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