小麥祖先的基因組測(cè)序
由于其巨大的尺寸和復(fù)雜性,對(duì)面包小麥基因組的測(cè)序長期以來被認(rèn)為是幾乎不可逾越的任務(wù)。然而,它對(duì)全球食品供應(yīng)至關(guān)重要,提供超過20%的卡路里和23%的人類消費(fèi)蛋白質(zhì)。
現(xiàn)在,研究人員在加州大學(xué)戴維斯分校的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)國際研究小組,已經(jīng)邁進(jìn)了一步測(cè)序面包的野生祖先的基因組中解決難題的小麥被稱為粗山羊草,一類goatgrass的。
在11月15日發(fā)表在“自然”雜志上的研究中,研究人員應(yīng)用了一系列先進(jìn)技術(shù),為Ae生成了參考質(zhì)量的基因組序列。tauschii,適應(yīng)性強(qiáng),耐受疾病。它也是小麥粉面包制作基因的主要來源。
研究結(jié)果將使研究人員能夠發(fā)現(xiàn)可以提高小麥烘焙質(zhì)量,抗病能力以及對(duì)霜凍,干旱和鹽度等極端環(huán)境條件的耐受性的新基因。
這項(xiàng)努力已經(jīng)取得了一個(gè)實(shí)際成果:發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)抗小麥莖銹病新基因的基因,小麥幾乎沒有抗性?;驈腁e轉(zhuǎn)移。tauschii進(jìn)入小麥,現(xiàn)在可供小麥育種者使用。
拼湊拼圖
小麥及其野生祖先的基因組比人類大得多,這使得測(cè)序變得困難。
“當(dāng)我們近二十年前開始這個(gè)項(xiàng)目時(shí),沒有技術(shù)可以對(duì)這種規(guī)模和復(fù)雜性的基因組進(jìn)行測(cè)序,”加州大學(xué)戴維斯分校植物科學(xué)系的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人兼教授Jan Dvorak說。“這組植物是獨(dú)一無二的,因?yàn)樗鼈兊幕蚪M完全是重復(fù)的序列。我們發(fā)現(xiàn)超過84%的Ae.tauschii基因組由密切相關(guān)的重復(fù)序列組成。”
德沃夏克將這個(gè)項(xiàng)目描述為像撕毀一本厚書的頁面并試圖將它拼湊在一起。“只能想象頁面上的每個(gè)句子幾乎都是相同的。這是我們的任務(wù),”德沃夏克說。
研究人員使用的技術(shù)可以應(yīng)用于任何植物基因組,因此其影響超出了小麥。
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