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      魚類，兩棲動(dòng)物和爬行動(dòng)物中的DNA“化石”揭示了逆轉(zhuǎn)錄病毒的深層次多樣性
      
			
      
				2019-04-16 10:00:53
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      根據(jù)中國(guó)南京師范大學(xué)的Xiaoyu Xu及其同事在PLOS病原體中提出的新研究，逆轉(zhuǎn)錄病毒是一種廣泛的感染人類和其他脊椎動(dòng)物的病毒，其多樣性比以前認(rèn)為的要大得多。
      

      魚類，兩棲動(dòng)物和爬行動(dòng)物中的DNA“化石”揭示了逆轉(zhuǎn)錄病毒的深層次多樣性
      

      逆轉(zhuǎn)錄病毒包括HIV和其他在許多不同脊椎動(dòng)物物種中引起疾病??的病毒。大多數(shù)逆轉(zhuǎn)錄病毒研究都集中在哺乳動(dòng)物和鳥類，但逆轉(zhuǎn)錄病毒也會(huì)感染許多其他脊椎動(dòng)物。因此，逆轉(zhuǎn)錄病毒的總體多樣性和深度進(jìn)化史一直是模糊的。
      

      為了提高對(duì)逆轉(zhuǎn)錄病毒的認(rèn)識(shí)，Xu及其同事研究了脊椎動(dòng)物DNA中的分子“化石”。這些“化石”可能來自逆轉(zhuǎn)錄病毒的正常感染周期：逆轉(zhuǎn)錄病毒將其遺傳信息存儲(chǔ)在RNA中，但當(dāng)它們感染脊椎動(dòng)物細(xì)胞時(shí)，它們將其RNA轉(zhuǎn)錄成整合到宿主基因組中的DNA。如果這發(fā)生在脊椎動(dòng)物的生殖細(xì)胞中，病毒代碼可以保存并通過許多代傳遞給后代。保存的遺傳密碼被稱為內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒。
      

      研究人員在72種魚類，4種兩棲動(dòng)物和16種爬行動(dòng)物的基因組中尋找并分析了內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒。他們鑒定了超過8,000種內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒，并能夠重建其中約450種的全部或部分基因組。這些發(fā)現(xiàn)極大地?cái)U(kuò)展了已知的逆轉(zhuǎn)錄病毒的數(shù)量，并表明今天在非禽/哺乳動(dòng)物宿主之間傳播的非內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒的多樣性可能遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過目前的想象。
      

      基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析表明，在它們的進(jìn)化過程中，許多非禽/哺乳動(dòng)物逆轉(zhuǎn)錄病毒經(jīng)常從一種優(yōu)選的宿主物種轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N。分析還表明，逆轉(zhuǎn)錄病毒經(jīng)常在水和陸地物種之間傳播，這表明多種水生進(jìn)化起源。
      

      本研究中的92種脊椎動(dòng)物僅占非鳥類/哺乳動(dòng)物脊椎動(dòng)物多樣性的約0.2%，因此很可能還有更多的內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒未被發(fā)現(xiàn)。揭示其多樣性和進(jìn)化歷史可以幫助預(yù)測(cè)，預(yù)防和減少逆轉(zhuǎn)錄病毒爆發(fā)的持續(xù)努力。
      
			

			
        
      
			
      
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