開創(chuàng)性研究的癌癥代謝主題
無論癌癥在體內(nèi)采取何種形式,它都從細(xì)胞水平開始,并通過新陳代謝生長(zhǎng)。根據(jù)史密斯化學(xué)與生物分子工程學(xué)院的William C. Hooey主任和Gordon L. Dibble教授Abe Stroock的說法,了解癌癥代謝改變已經(jīng)引起了新的研究興趣。他的最新研究探討了多種尺度的癌癥代謝,并為未來的研究奠定了理論基礎(chǔ)。
“在某種意義上,癌癥具有明顯的新陳代謝,并且它是已確定的細(xì)胞和亞細(xì)胞規(guī)模的最早[疾病]特征之一,”Stroock說,“Warburg的多尺度計(jì)算研究”的高級(jí)作者效應(yīng),反向Warburg效應(yīng)和谷氨酰胺成癮在實(shí)體瘤中,“最近發(fā)表于PLOS計(jì)算生物學(xué)。
Mengrou Shan,博士,Stroock實(shí)驗(yàn)室的前Samuel C. Fleming家庭研究員,是第一作者。
大約100年前,德國(guó)生理學(xué)家和諾貝爾獎(jiǎng)獲得者Otto Warburg假設(shè)癌癥生長(zhǎng)是由線粒體消耗異常量的葡萄糖引起的,即使在氧氣存在的情況下也是如此。健康細(xì)胞僅在沒有氧氣的情況下消耗葡萄糖。這種癌癥代謝改變現(xiàn)象被稱為Warburg效應(yīng)。
Warburg推測(cè)癌癥首先是一種代謝性疾病,但隨后的研究提出了基因突變是癌癥根源的觀點(diǎn)。
“Warburg聲稱這種代謝缺陷是癌癥的起源,在很重要的方面,今天已被駁回,”Stroock說。“但我們?nèi)匀粺o法治愈癌癥,所以關(guān)于與癌癥遺傳相關(guān)的新陳代謝的問題又回到了談判桌上。”
Stroock說,當(dāng)癌細(xì)胞消耗葡萄糖時(shí),他們通過稱為糖酵解的過程來實(shí)現(xiàn),其中大量的葡萄糖轉(zhuǎn)化為乳酸。這是一種使用葡萄糖的非常低效的方式 - 當(dāng)疲勞的肌肉厭氧消耗糖時(shí)會(huì)發(fā)生相同的現(xiàn)象,如果不加以控制會(huì)導(dǎo)致乳酸性酸中毒。
該研究的目標(biāo)之一是找出癌癥新陳代謝中是否以及如何奇怪,如Warburg效應(yīng),幫助或傷害腫瘤生長(zhǎng)。例如:鑒于糖酵解的內(nèi)在低效率,腫瘤細(xì)胞相對(duì)于健康組織應(yīng)該處于不利地位。
“令人質(zhì)疑的一個(gè)原因是,我們目前對(duì)腫瘤的了解是基于適者生存,”Stroock說。“它[癌癥]獲勝是因?yàn)榘┘?xì)胞違背了良好組織細(xì)胞的規(guī)則,即”做你被告知的事情“和”有遺傳完整性“。在這樣做時(shí),腫瘤勝過健康組織。“
Stroock旨在確定這種重新連接的代謝過程的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì),在多種尺度 - 細(xì)胞內(nèi),細(xì)胞,多細(xì)胞 - 并創(chuàng)建這樣做的工具。該小組在三種代謝情景中對(duì)這些過程進(jìn)行了建模:
Warburg效應(yīng)(有氧消耗葡萄糖);
谷氨酰胺成癮,被視為癌癥代謝的標(biāo)志,并且;
反向Warburg效應(yīng),其中癌細(xì)胞“劫持”腫瘤微環(huán)境中的非癌細(xì)胞并迫使它們像癌細(xì)胞一樣消耗葡萄糖。
該小組使用的工具之一是通量平衡分析(FBA),一種用于確定單個(gè)細(xì)胞內(nèi)整個(gè)代謝過程中營(yíng)養(yǎng)素利用率的計(jì)算方法。
在實(shí)體瘤形式的細(xì)胞群模型中使用FBA的結(jié)果,該組證實(shí)了Warburg效應(yīng)為腫瘤提供了生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì),但谷氨酰胺成癮不利于腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)。“我們表明,對(duì)于腫瘤來說,對(duì)谷氨酰胺成癮沒有幫助,”Stroock說。“社區(qū)必須找到谷氨酰胺重要的其他方式。”
Stroock的團(tuán)隊(duì)還提供了在逆向Warburg效應(yīng)下健康細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞之間關(guān)系的見解,這可以讓更多的氧氣在資源有限的微環(huán)境中穿透癌細(xì)胞。
Stroock表示,該小組的工作雖然為未來的研究敞開了大門,但也證實(shí)了近百年的理論。“它將這一古老的假設(shè)置于更穩(wěn)固的基礎(chǔ)上,”他說,“我們現(xiàn)在更加定量地了解癌細(xì)胞如何使用這種Warburg機(jī)制。”
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