使用正確的算法優(yōu)化細(xì)胞周期分析
HelmholtzZentrumMünchen的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了一種新的方法,使用成像流式細(xì)胞儀數(shù)據(jù)改善細(xì)胞周期階段的識別。他們可以通過應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)算法來避免使用污點(diǎn)。在成像軟件的幫助下,他們從明場和暗場圖像中提取了數(shù)百個(gè)特征。使用這些數(shù)據(jù),他們可以生成可以數(shù)字排序單元格的算法。
到目前為止,已經(jīng)使用熒光染料將細(xì)胞分配到它們的細(xì)胞周期階段。這些化學(xué)物質(zhì)會破壞細(xì)胞,并可能使結(jié)果失真。HelmholtzZentrumMünchen的科學(xué)家與麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué),斯旺西大學(xué),紐卡斯?fàn)柎髮W(xué)和弗朗西斯克里克研究所合作,現(xiàn)在已經(jīng)找到了另一種選擇。
“我們使用了兩個(gè)普遍被忽視的數(shù)據(jù)來源:明亮和黑暗的圖像 ”,ICB的博士生,該出版物的第一作者Thomas Blasi說。“我們可以將這些數(shù)據(jù)中的信息用于機(jī)器學(xué)習(xí) ”。這種方法不僅可以對細(xì)胞進(jìn)行分類,還可以對其進(jìn)行數(shù)字化排序,具有高度的特異性。根據(jù)這些調(diào)查結(jié)果,Broad Institute和HelmholtzZentrumMünchen也提交了臨時(shí)專利申請。
“基于計(jì)算機(jī)的基于大量細(xì)胞圖像的細(xì)胞分類開辟了新的視角。這種方法也可用于許多不同的環(huán)境,不僅用于細(xì)胞周期分析”,F(xiàn)abian Theis博士教授,博士ICB。
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