即使使用混合纖維 染色質(zhì)也不會(huì)改變其三維結(jié)構(gòu)
“間期”是指細(xì)胞周期中染色體花費(fèi)大部分時(shí)間的時(shí)期。在這個(gè)階段,在有絲分裂之間,染色體在細(xì)胞核中“溶解”,進(jìn)行遺傳物質(zhì)復(fù)制所需的過程。不幸的是,我們目前關(guān)于間期染色體行為的知識(shí)非常有限;例如,我們需要更多地了解染色質(zhì)細(xì)絲的三維結(jié)構(gòu) - 構(gòu)成染色體的長分子,由DNA和其他蛋白質(zhì)組成 - 以及它在時(shí)間和空間上的變化。染色體的形狀實(shí)際上是對(duì)于其功能很重要,因?yàn)樗试S或阻止對(duì)復(fù)制過程的遺傳密碼部分的訪問。
除實(shí)驗(yàn)觀察外,另一個(gè)重要的研究方法是基于染色質(zhì)理論模型的計(jì)算機(jī)模擬。一項(xiàng)新的研究擴(kuò)展了之前完成的工作,該工作使用了由單根纖維組成的更簡單的染色質(zhì)模型。在這項(xiàng)新研究中,燈絲可以由兩種類型的纖維組成,一種較厚,一種較薄,比例不同。實(shí)驗(yàn)研究確實(shí)證明存在兩種主要類型的染色質(zhì),厚度為10或30nm。在這項(xiàng)研究中,科學(xué)家們?cè)诟鞣N條件下對(duì)模型染色體進(jìn)行了分子動(dòng)力學(xué)模擬:他們?cè)诰畚锶旧|(zhì)中加入了越來越多的10nm纖維,僅由較硬的30nm纖維組成。
新研究中使用的模型雖然簡化了真實(shí)分子,但卻使模擬更加真實(shí)。該研究的目的是評(píng)估染色質(zhì)纖維中的小規(guī)模修飾是否導(dǎo)致染色體行為的大規(guī)模變化。“即使在引入更靈活的第二種纖維后,染色體仍保持空間穩(wěn)定性”,該研究的第一作者,SISSA研究科學(xué)家Ana-Maria Florescu解釋道。協(xié)調(diào)工作的SISSA研究員Angelo Rosa補(bǔ)充說:“更詳細(xì)”,我們發(fā)現(xiàn)重組僅發(fā)生在低于0.1 Mbp(百萬堿基對(duì))的空間尺度和短于幾秒的時(shí)間尺度上。
這項(xiàng)研究的一個(gè)重要意義涉及用于纖維實(shí)驗(yàn)觀察的技術(shù):當(dāng)今最常用的技術(shù)沒有足夠的分辨率來觀察這種類型的重組,因此我們的目標(biāo)是開發(fā)新的方法(如基于FISH的FISH技術(shù))寡核苷酸)能夠顯現(xiàn)甚至小于0.1 Mbp的基因組距離。
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