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      葉綠體基因組序列苦甜
      
			
      
				2019-04-19 10:02:34
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      關(guān)于質(zhì)體組織和進(jìn)化的信息對(duì)于改良作物植物和解決光合生物的系統(tǒng)發(fā)育至關(guān)重要。最近赫爾辛基大學(xué)芬蘭自然歷史博物館的研究人員對(duì)一種名為苦甜(Solanum dulcamara)的雜草的質(zhì)體基因組進(jìn)行了測(cè)序。
      

      葉綠體基因組序列苦甜
      

      第一個(gè)完整的plastome核苷酸序列于1986年發(fā)表于茄屬植物(茄科)的煙草(Nicotiana tabacum L.)。這個(gè)具有重要經(jīng)濟(jì)意義的大型多樣植物家族包含著名的作物和觀賞植物，如馬鈴薯，番茄，茄子和矮牽牛花。在PLoS ONE發(fā)表的研究中，赫爾辛基大學(xué)芬蘭自然歷史博物館(LUOMUS)的研究人員對(duì)苦甜(Solanum dulcamara L.)的質(zhì)體基因組進(jìn)行了測(cè)序，為葉綠體工程提供基因組資源。它是一種在芬蘭也常見的二倍體雜草，對(duì)由水霉菌(卵菌)致病疫霉引起的最重要的馬鈴薯病晚疫病具有抗性。
      

      研究結(jié)果比最初的想法更重要：
      

      研究PéterPoczai的研究負(fù)責(zé)人表示，“當(dāng)我們?cè)噲D將苦甜的plastome與其他茄屬物種進(jìn)行比較時(shí)，我們意識(shí)到它無法正常完成，因?yàn)榛蚪M注釋似乎包含了很多錯(cuò)誤。”
      

      該研究首次表明，這些錯(cuò)誤是由于全世界使用的一種簡(jiǎn)單過時(shí)的軟件造成的。結(jié)果，這些錯(cuò)誤被復(fù)制并在遺傳數(shù)據(jù)庫中從一個(gè)序列傳播到另一個(gè)序列。
      

      “通過努力工作和手工編輯，我們已經(jīng)糾正了所有茄科基因組的這些錯(cuò)誤，這些基因組將苦樂參半作為茄屬植物葉綠體比較基因組學(xué)的模型。由于大多數(shù)測(cè)序項(xiàng)目，一般來說，質(zhì)體基因組學(xué)中注釋錯(cuò)誤的存在仍然存在。正在使用這個(gè)過時(shí)的軟件，我們相信它需要被一個(gè)已經(jīng)計(jì)劃作為我們下一個(gè)前沿項(xiàng)目的更先進(jìn)的工具所取代，“Ali Amiryousefi，Ph.D。LUOMUS的學(xué)生和該研究的第一作者補(bǔ)充說。
      

      提出了一個(gè)新的祖先基因組假說
      

      只有經(jīng)過這些改進(jìn)，LUOMUS小組才能最終對(duì)所有的夜間質(zhì)體基因組進(jìn)行比較分析，他們提出了祖先基因組的假設(shè)。通過這一點(diǎn)，他們能夠證明結(jié)構(gòu)重新安排與這個(gè)家庭更大的進(jìn)化變化相吻合。常見雜草苦甜的質(zhì)體基因組序列將有助于對(duì)夜間質(zhì)體基因組注釋進(jìn)行基準(zhǔn)測(cè)試，并可作為進(jìn)一步研究的可靠參考。
      

      “本研究是我們利用LUOMUS的活體溫室和植物標(biāo)本館收集葉綠體基因組測(cè)序和研究開花植物多樣性的研究的一部分。到目前為止，我們已經(jīng)從我們的收集中測(cè)序了30個(gè)質(zhì)體基因組，現(xiàn)在開始的第一批結(jié)果發(fā)表“總結(jié)Poczai。
      
			

			
        
      
			
      
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