海洋學(xué)家成長 海洋微生物的基因組序列對氣候變化很重要
海龜和鯨魚可能是海洋中具有魅力的生物,但海洋的真正主要部分占海洋生物量的98% - 而且個(gè)別太小,肉眼看不到。這些是海洋微生物,是一組多樣的生物,包括微藻,病毒,細(xì)菌和古細(xì)菌。它們是海洋食物鏈的基礎(chǔ),負(fù)責(zé)控制大部分海洋的養(yǎng)分流和健康。
但鑒于它們的流行程度,人們很少知道它們?nèi)绾卧诤Q笾邢嗷プ饔貌?shí)施基本過程,特別是在氣候變化影響日益顯著的深低氧水域。在這些地區(qū),由于海水變暖和循環(huán)較少,由于過度驅(qū)動(dòng)的微生物過程,高達(dá)一半的可用氮 - 一種對所有海洋生物至關(guān)重要的營養(yǎng)物 - 都會(huì)丟失。
現(xiàn)在,華盛頓大學(xué)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)已經(jīng)對已知存在于這些地區(qū)的常見但知之甚少的細(xì)菌有了新的認(rèn)識(shí)。通過對微生物的整個(gè)基因組進(jìn)行培養(yǎng)和測序,海洋學(xué)家發(fā)現(xiàn)它以新的和令人驚訝的方式顯著地促進(jìn)了從水中去除生命支持的氮。
“如果我們想了解海洋是如何工作的,并能夠以任何預(yù)測的方式對海洋進(jìn)行建模,我們需要更準(zhǔn)確地了解輸入和輸出是什么,”資深作者,海洋學(xué)副教授Robert Morris說。 。“這是一種重要的有機(jī)體,可以固定碳,參與氮的流失,并且是由于氣候變化而在海洋的一部分。我們現(xiàn)在擁有實(shí)驗(yàn)室中的第一個(gè)文化,我們可以研究它的生理學(xué)。”
該研究結(jié)果將于7月19 日出現(xiàn)在自然出版物“ 多學(xué)科微生物生態(tài)學(xué)雜志”上。
該生物體名為Candidatus Thioglobus autotrophicus,存在于世界各地的低氧水域中,是這些地區(qū)的主要生物之一 - 在某些地區(qū),占所有細(xì)胞的40%至60%。
生物利用氧氣進(jìn)行代謝活動(dòng),但在低氧區(qū)域,細(xì)菌和古細(xì)菌已經(jīng)進(jìn)化為“呼吸”海水中的其他元素。其中之一是一種名為硝酸鹽的化學(xué)物質(zhì),當(dāng)受到呼吸時(shí)會(huì)產(chǎn)生氣態(tài)氮。這種氣體逃逸到大氣中,有效地離開海洋并從水中去除有價(jià)值的氮。
由威斯康星海洋學(xué)家培育和測序的細(xì)菌被認(rèn)為在從海洋中去除氮?dú)夥矫姘l(fā)揮了重要作用,但到目前為止,科學(xué)家還沒有完全了解它是如何發(fā)生的。
“我們通過提供完整的基因組來填補(bǔ)空白,”主要作者,海洋學(xué)博士生Vega Shah說。“現(xiàn)在我們可以談?wù)撨@些生物能做什么和不能做什么。”
該研究小組證實(shí),這種細(xì)菌會(huì)導(dǎo)致氮素流失,但其方式與預(yù)期不同。更具體地說,他們負(fù)責(zé)關(guān)鍵步驟 - 將硝酸鹽轉(zhuǎn)化為類似的亞硝酸鹽化學(xué)品 - 然后繼續(xù)為其他氮去除過程提供燃料。早期的研究假設(shè)這些微生物也產(chǎn)生氨,這是另一種含氮化學(xué)物質(zhì)。相反,UW團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)微生物消耗氨,基本上與其他生物競爭這種對于生長和發(fā)育也很重要的氮化合物。
在全球范圍內(nèi),隨著氣候變化產(chǎn)生產(chǎn)生低氧區(qū)的條件,包括更溫暖的海洋溫度和更少的水循環(huán),這些細(xì)菌生存的海洋區(qū)域變得越來越大。
“從大局來看,我們知道容納這些生物體的不同類型的氧氣最小區(qū)域變得更大,更持久,”Shah說。“因此,無論這些錯(cuò)誤對水化學(xué)的影響如何,大氣層將變得越來越重要 - 基本上,它們的棲息地正在擴(kuò)大。”
在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)這種有機(jī)體并非易事。威斯康星大學(xué)的海洋學(xué)家將幾種技術(shù)結(jié)合起來,盡可能地將細(xì)菌培養(yǎng)在原生海洋環(huán)境中?;藢⒔荒甑臅r(shí)間才將它們穩(wěn)定到研究人員可以開始進(jìn)行生理實(shí)驗(yàn)的程度。
然而,即使是實(shí)驗(yàn)也比平時(shí)花費(fèi)更多時(shí)間,因?yàn)檫@些生物比實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)的大多數(shù)培養(yǎng)物生長得慢得多。
“大多數(shù)實(shí)驗(yàn)持續(xù)10到15天,因?yàn)樗鼈兊纳L速度非常慢。但優(yōu)勢在于它們實(shí)際上與它們在海洋環(huán)境中的表現(xiàn)非常相似,”莫里斯說。
在學(xué)生研究巡航期間,Shah從R / V Thomas G. Thompson的不列顛哥倫比亞省海岸的低氧海灣收集了該生物。然后,她使用這些生物在實(shí)驗(yàn)室中種植相同的后代。
研究人員接下來將研究這種細(xì)菌在海洋碳和硫循環(huán)中的作用。他們最近還獲得了國家科學(xué)基金會(huì)的資助,用于研究這個(gè)有機(jī)體及其親屬在世界各地的其他低氧區(qū)域,包括墨西哥沿海地區(qū)。
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