酵母生產(chǎn)乙醇以防止代謝過載
為什么有些酵母細胞會產(chǎn)生乙醇?幾十年來,科學(xué)家一直在想這種明顯的資源浪費。現(xiàn)在,格羅寧根大學(xué)的科學(xué)家認為他們有一個解決方案:酵母細胞產(chǎn)生乙醇作為“安全閥”,以防止當(dāng)他們的代謝操作達到臨界水平時過載。1月7日發(fā)表在“ 自然代謝 ” 雜志上的這一新理論的意義可能是深遠的,因為它也解釋了為什么癌細胞通過產(chǎn)生乳酸而浪費能量,稱為Warburg效應(yīng)。
細胞利用葡萄糖等營養(yǎng)素制造新細胞。但有時,這些營養(yǎng)素中的一些會被浪費掉。例如,用于生產(chǎn)啤酒的酵母釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)將葡萄糖分解成乙醇而不是二氧化碳。“將六碳分子代謝為二碳分子,而不是二氧化碳,意味著能量的一部分,葡萄糖中儲存的物質(zhì)就會丟失。格羅寧根大學(xué)分子系統(tǒng)生物學(xué)教授Matthias Heinemann說,這毫無意義。
代謝
進化應(yīng)該結(jié)束這種資源的浪費,因此生物學(xué)家試圖找到它存在的理由。海涅曼說,在其他細胞中可以看到類似的浪費。眾所周知的例子是癌細胞。這些快速生長的細胞分泌乳酸,這是一種類似的能量浪費。許多細菌也會浪費能量。“不同生物之間的這種相似性使我們懷疑是否存在共同點。”
Heinemann的研究領(lǐng)域是新陳代謝,這是一種化學(xué)反應(yīng)網(wǎng)絡(luò),可為新細胞提供構(gòu)建模塊。他假設(shè)細胞能夠運作新陳代謝的速率上限。他的博士生是Bastian Niebel和Simeon Leupold,他模仿了Gibbs在細胞中的能量耗散。這是在細胞中發(fā)生的所有化學(xué)反應(yīng)釋放的能量。
一些普遍的東西
通過將熱力學(xué)加入到具有約1,000個化學(xué)反應(yīng)的模型中并將模型與實驗數(shù)據(jù)相結(jié)合,Heinemann能夠確定作為葡萄糖攝取函數(shù)的吉布斯能量耗散率。起初,吉布斯能量消耗隨著葡萄糖消耗速率的增加而增加,但隨后達到平臺 - 此時乙醇生產(chǎn)開始。“這是細胞從呼吸轉(zhuǎn)向發(fā)酵的關(guān)鍵點,”海涅曼解釋說。
Heinemann和他的團隊獲得了腸道細菌大腸桿菌的類似結(jié)果,其平臺處于可比較的吉布斯能量耗散水平。Heinemann:'酵母和大腸桿菌生活在完全不同的環(huán)境中,但具有相同的耗散極限,甚至大約相同的值。這表明這種限制具有普遍性。這種限制的確切原因尚不清楚,但科學(xué)家們提出了一個有效的假設(shè)。“細胞新陳代謝的最大速率仍然可以運作。” 當(dāng)達到此目的時,細胞打開“安全閥”,葡萄糖被分解為乙醇,乙酸鹽或乳酸鹽,留下部分能量未使用。
損傷
那么是什么造成了這個限制?'部分能量以熱量的形式消散,但這太少而不能打擾細胞。我們的想法是,當(dāng)酶催化化學(xué)反應(yīng)時,它們在反應(yīng)過程中受到微小的推動,這使它們移動。如果它們工作得非??欤@可能意味著細胞內(nèi)部運動過多,這可能會破壞某些細胞結(jié)構(gòu)。研究不同代謝率下細胞內(nèi)酶的運動可以證實這一點。
與此同時,海涅曼認為,他現(xiàn)在已經(jīng)解決了不僅酵母中乙醇生產(chǎn)的神秘面紗,還解決了癌細胞中華寶效應(yīng)的神秘面紗。大約一個世紀以前,已故的諾貝爾獎獲得者Otto Warburg觀察到癌細胞具有高的糖酵解速率和乳酸排泄。Heinemann認為,這種能量和物質(zhì)的浪費是“安全閥”:'有一些實驗正在進行阻止乳酸生成的藥物作為治療癌癥的方法。這些藥物的作用機制可能是關(guān)閉細胞的安全閥。
熵
但是,并非所有細胞都需要安全閥。'一些酵母菌株的葡萄糖攝取緩慢,因此它們永遠不會有代謝過載的危險。事實上,這些酵母物種不會產(chǎn)生乙醇,Heinemann說。
這一發(fā)現(xiàn)讓人想起ErwinSchrödinger的開創(chuàng)性著作“生命是什么”:“新陳代謝的關(guān)鍵在于有機體成功地將自己從活著時無法幫助的所有熵中解放出來。” Heinemann說,這個陳述應(yīng)該擴展如下:'但是,有一個上限速率,細胞可以從這個熵中解脫出來,這個限制決定了細胞如何運作它們的新陳代謝。
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