什么是癌癥基因?什么是癌癥基因檢測(cè)?
一、什么是癌癥基因?
癌細(xì)胞與正常細(xì)胞,有很多不同;其中,最重要的不同就是癌細(xì)胞中不少基因是變異的:有的基因缺失了,有的基因重復(fù)了,有的基因長(zhǎng)歪了……
癌癥中可能發(fā)生許多類型的基因改變。四種主要類型包括:
1) 單核苷酸變異體(SNV),也稱為點(diǎn)突變。SNV由一個(gè)堿基處的堿基置換產(chǎn)生。這些可能導(dǎo)致編碼蛋白的氨基酸序列(錯(cuò)義突變)或蛋白過(guò)早截短(無(wú)義突變)。
2) 連續(xù)核苷酸的小復(fù)制,涉及一個(gè)或幾個(gè)核苷酸的插入或缺失,或涉及同時(shí)缺失和插入一個(gè)或幾個(gè)堿基(indelsa)的復(fù)雜突變。這些類型的突變可能是“框內(nèi)的”,導(dǎo)致蛋白質(zhì)中氨基酸的加入或減少,或可導(dǎo)致“移碼”,通常導(dǎo)致蛋白質(zhì)的過(guò)早截短。
3) 外顯子或基因拷貝數(shù)目的變化。外顯子拷貝數(shù)變化包括包含整個(gè)外顯子并影響蛋白質(zhì)功能結(jié)構(gòu)域的大的重復(fù)或缺失?;?拷貝數(shù)變化包括整個(gè)基因的擴(kuò)增或缺失。
4) 遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)變異(SV)或大的結(jié)構(gòu)異常,包括由多個(gè)染色體之間或單個(gè)染色體內(nèi)的斷點(diǎn)引起的易位或倒位。這些通常導(dǎo)致融合基因和相關(guān)融合蛋白。
通常,致癌突變聚集在來(lái)自不同患者的腫瘤的“熱點(diǎn)”突變。一些熱點(diǎn)SNV可能會(huì)頻繁發(fā)生,而另一些則很少見(jiàn)。例如,在所有黑素瘤中,40%發(fā)生BRAF V600E 突變,而B(niǎo)RAF L597S 突變的發(fā)生<1%。
二、什么是癌癥基因檢測(cè)?
我們都知道,癌癥是一種具有遺傳傾向的疾病,跟基因突變有著千絲萬(wàn)縷的聯(lián)系,而這些基因在某些程度上,也決定了癌細(xì)胞的生長(zhǎng)與分裂,并且這種突變也可能會(huì)遺傳。這時(shí)候就可以針對(duì)腫瘤的基因圖譜進(jìn)行測(cè)試,從而確定到底是發(fā)生了哪些突變,而這個(gè)過(guò)程就叫做基因檢測(cè)。
在實(shí)際的治療過(guò)程中,基因檢測(cè)可以幫助醫(yī)生制定最佳的治療方案。比如:一些人患肺癌后,可以利用基因檢測(cè)的手段對(duì)癌細(xì)胞中的EGFR進(jìn)行檢測(cè),一旦發(fā)現(xiàn)了該突變,就可以利用對(duì)應(yīng)的靶向藥進(jìn)行治療。再比如,有一些非常難以確診的腫瘤,需要依靠特定的基因改變協(xié)助確診。比如,不少肉瘤都長(zhǎng)的像梭子一樣,長(zhǎng)長(zhǎng)扁扁的,這時(shí)候如果基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)有ASPL-TFE3融合基因,那診斷腺泡軟組織肉瘤,就八九不離十了。
利用各種方法,把這些變異的基因找出來(lái),仔細(xì)分析,可以協(xié)助臨床診斷、指導(dǎo)治療選擇、輔助監(jiān)測(cè)疾病復(fù)發(fā)和耐藥、預(yù)估生存期等。
腫瘤基因測(cè)試范圍從簡(jiǎn)單到復(fù)雜。最簡(jiǎn)單的測(cè)試只檢測(cè)一種基因中的一種類型的突變。比如僅在BRAF位置c.1799處尋找特定T到A置換突變的試驗(yàn)。
相反,最復(fù)雜的測(cè)試可以同時(shí)檢測(cè)所有主要類型的基因改變,包括替換,重復(fù),插入,缺失,插入,基因拷貝數(shù) 變異和結(jié)構(gòu)變體,包括倒位和易位。
三、什么是基于基因檢測(cè)的靶向治療?
在惡性腫瘤的治療中,一個(gè)令人困惑的問(wèn)題就是:同一分期、同一病理類型的惡性腫瘤患者,采用相同的治療方案,其療效(如生存期)為什么會(huì)存在明顯差異?
隨著人類基因組計(jì)劃的完成,研究人員發(fā)現(xiàn)同一類型腫瘤的細(xì)胞分子生物學(xué)差異可能是導(dǎo)致疾病個(gè)體化差異的原因所在,繼而發(fā)現(xiàn)了一些與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的基因,即腫瘤的“驅(qū)動(dòng)基因”。肺癌已知的驅(qū)動(dòng)基因包括EGFR、ALK、KRAS、HER2、BRAF、PIK3CA、AKTI、MEKI、NRAS和MET。驅(qū)動(dòng)基因不同,患者對(duì)腫瘤的治療反應(yīng)也就不同,這就是相同分型、分期的腫瘤患者存在療效差異的原因。
目前一些藥物如靶向藥物具有特異性針對(duì)某種腫瘤基因突變達(dá)到精準(zhǔn)殺傷的效果,而不同腫瘤患者腫瘤驅(qū)動(dòng)基因突變存在差異,因此通過(guò)基因檢測(cè),了解患者哪種基因發(fā)生突變,適合應(yīng)用哪種藥物,也就達(dá)到了“量體裁衣”的效果,做到了“精準(zhǔn)醫(yī)療”。
比如,晚期肺腺癌病友,超過(guò)一半都攜帶EGFR、ALK、ROS-1等基因突變,這類病人就有機(jī)會(huì)嘗試靶向藥了,有效率高、副作用小、生存期相對(duì)較長(zhǎng)。甚至有一些患者依靠一代一代的靶向藥聯(lián)合傳統(tǒng)放化療,生存期超過(guò)10年、20年的超級(jí)幸運(yùn)案例。
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