支原體檢測驗證方案
-
YCJ制
XXXXXXXX
項目名稱EZ-PCR檢測支原體驗證方案
項目編號
起草人
審核人
批準人
日期
日期
日期
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YCJ制
目錄
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
概述....................................................................................................................................3
適用范圍............................................................................................................................3
驗證目的............................................................................................................................3
驗證項目............................................................................................................................3
參考文件............................................................................................................................3
驗證小組成員及職責(zé)........................................................................................................4
驗證過程............................................................................................................................4
實驗材料....................................................................................................................4
實驗儀器及設(shè)備........................................................................................................4
專屬性驗證................................................................................................................4
檢測限驗證................................................................................................................6
重現(xiàn)性驗證................................................................................................................8
耐用性驗證................................................................................................................9
7.1.
7.2.
7.3.
7.4.
7.5.
7.6.
8.
9.
驗證結(jié)果分析..................................................................................................................11
驗證評價..........................................................................................................................11
10.驗證結(jié)論..........................................................................................................................11
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1.概述
支原體(Mycoplasma)屬于柔膜體綱,是介于細菌和病毒之間的一類無細胞壁的
原核細胞微生物,是目前所知能在無生命培養(yǎng)基中生長繁殖的最小的微生物。與梭菌
屬、酸桿菌屬及鏈球菌屬在進化上相近。支原體是細胞污染物中比較常見的一種,
細胞受支原體污染程度較輕時,不會表現(xiàn)出明顯的癥狀,但一旦這種潛伏的污染爆發(fā)
時,細胞會大量脫落,細胞培養(yǎng)液會變渾濁。原代細胞和傳代細胞都可能遭受支原體
污染,根據(jù)國外不同實驗室的調(diào)查結(jié)果顯示,有15%-80%的細胞被支原體污染,傳
代細胞的污染率高于原代細胞。盡管自然界中存在的支原體有120多種,但污染細
胞的支原體主要有5種,分別為牛源的萊氏無膽甾原體和精氨酸支原體,人源的口
腔支原體和發(fā)酵支原體,豬源的豬鼻支原體,這5種支原體占所有支原體污染的95%
以上。支原體污染可能來自操作人員和細胞培養(yǎng)用原材料如血清和胰蛋白酶,也可能
來自于本身已被污染的細胞系和毒種。細胞受支原體污染后,功能和活性都會受到影
響,會帶來不可靠的實驗結(jié)果和不安全的細胞制品,因此對細胞進行支原體檢測實屬
必要。
我國藥典第三部明確規(guī)定主細胞庫、工作細胞庫、病毒種子批、對照細胞以及臨
床治療用細胞進行支原體檢查時,應(yīng)同時進行培養(yǎng)法和指示細胞培養(yǎng)法(DNA染
法)。直接培養(yǎng)法具有較高的靈敏度,但整個實驗所需周期長,指示細胞法相對實驗
周期短。生物化學(xué)法干擾因素較多,ELISA法檢測范圍有限,因此這兩個方法都不
能得到普及。在這些方法出現(xiàn)的同時,PCR法得到了發(fā)展,PCR因其高敏感性、明
確及快捷的特點簡化了細胞培養(yǎng)中支原體污染檢測過程。BI的EZ-PCR方法檢測支
原體,檢測用的樣品僅經(jīng)過離心分離及懸浮在緩沖液中即可開始PCR反應(yīng)。瓊脂糖
凝膠電泳后,陽性模板得到一個270bp的片段,整個過程只需3-4小時。
2.適用范圍
本驗證方法適用于BI公司的EZ-PCR支原體污染檢測試劑盒檢測細胞終制品中支
原體污染方法的驗證
3.驗證目的
建立細胞終制品的EZ-PCR支原體檢測,并對其有效性進行評價,確保試驗方法
的穩(wěn)定性,保證試測結(jié)果真實可靠。
4.驗證項目
對該方法的專屬性、檢測限、重現(xiàn)性及耐用性逐一進行驗證。
5.參考文件
《中國藥典》2015版3301支原體檢查法
《中國藥典》2015版9201藥品微生物檢驗替代方法驗證指導(dǎo)原則
《終制品支原體檢測標準操作規(guī)程》
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6.驗證小組成員及職責(zé)
姓名職責(zé)
7.驗證過程
7.1.實驗材料
7.1.1.菌種:肺炎支原體(ATCC15531株)、口腔支原體(ATCC23714株)、丁酸梭菌、
酸桿菌、肺炎鏈球菌。
7.1.2.細胞:無支原體污染的Vero細胞。
7.1.3.培養(yǎng)基:支原體液體培養(yǎng)基、精氨酸支原體肉湯培養(yǎng)基、支原體半流體培養(yǎng)基、DMEM
完全培養(yǎng)基、DMEM無抗生素培養(yǎng)基。
7.1.4.試劑:二苯甲酰胺熒光染料工作液、固定液、封片液、SYBR熒光染料等。
7.1.5.試劑盒:EZ-PCR支原體污染檢測試劑盒、DNA提取試劑盒等。
7.1.6.其他:無菌水、Marker、瓊脂糖等。
7.2.實驗儀器及設(shè)備
PCR儀、電泳儀、離心機、二氧化碳孵箱、超凈工作臺、熒光顯微鏡等。
7.3.專屬性驗證
7.3.1.定義:專屬性是指檢測樣品中可能存在的特定微生物種類的能力,其專屬性驗證應(yīng)
確認檢測系統(tǒng)中的外來成分不得干擾試驗而影響結(jié)果。
7.3.2.說明:本實驗專屬性驗證采用無支原體污染的Vero細胞代替樣品細胞來確認樣品細
胞DNA的存在是否對檢驗結(jié)果造成影響;用與支原體進化相似的丁酸梭菌、酸桿
菌、肺炎鏈球菌代替支原體進行檢驗,來驗證相似微生物的DNA是否對檢驗結(jié)果造
成影響。
細胞驗證:用DNA提取試劑盒提取Vero細胞DNA,過程中注意防止支原體污
染,依據(jù)EZ-PCR支原體污染檢測試劑盒使用說明對提取的DNA進行EZ-PCR擴增,
電泳,最后進行凝膠成像,觀察結(jié)果,在270bp左右是否出現(xiàn)特異性條帶。以加入
支原體菌株的Vero細胞樣品作為樣品陽性對照;以上實驗做5組平行。結(jié)果記錄如
下表:(原始電泳圖見附件一)
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項目
陰性對照
編號
1
1
無支原體
Vero細胞
2
3
4
5
實驗人/日期
結(jié)果
支原體陽性
Vero細胞
項目
陽性對照
編號
1
1
2
3
4
5
審核人/日期
結(jié)果
注:在“結(jié)果”中,270bp左右無條帶記錄為“—”,有條帶記錄為“+”。
結(jié)果說明:當(dāng)陰性對照為“—”,陽性對照為“+”,實驗結(jié)果方有效。若“無支原體
Vero細胞”結(jié)果均為“—”,“支原體陽性Vero細胞”結(jié)果均為“+”,則說明樣品細
胞DNA的存在不會對檢驗結(jié)果造成影響,若結(jié)果有異,則需重新驗證。
7.3.4.相似菌株驗證:用試劑盒分別提取丁酸梭菌、酸桿菌、肺炎鏈球菌DNA,方法同
Vero細胞驗證,每個樣品做5組平行,結(jié)果記錄如下:(原始電泳圖見附件二)
項目
陰性對照
編號
1
1
2
丁酸梭菌3
4
5
1
2
肺炎鏈球菌3
4
5
實驗人/日期
結(jié)果
口腔支原體
酸桿菌
項目
陽性對照
編號
1
1
2
3
4
5
1
2
3
4
5
審核人/日期
結(jié)果
注:在“結(jié)果”中,270bp左右無條帶記錄為“—”,有條帶記錄為“+”。
結(jié)果說明:當(dāng)陰性對照為“—”,陽性對照為“+”,實驗結(jié)果方有效。若“丁酸梭菌”
“酸桿菌”“肺炎鏈球菌”結(jié)果均為“—”,“口腔支原體”結(jié)果均為“+”,則說明
與支原體類似菌株不會對檢驗結(jié)果造成影響,若結(jié)果有異,則需重新驗證。
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7.4.檢測限驗證
7.4.1.定義:檢測限是指在替代方法設(shè)定的檢驗條件下,樣品中能被檢出的微生物的最低
數(shù)量。
7.4.2.說明:檢測限確定的方法是在有樣品中接種較低濃度的支原體(每單位不超過5CFU),
然后分別采用藥典直接培養(yǎng)法、指示細胞培養(yǎng)法和EZ-PCR法對支原體進行檢驗,以
檢出與否來比較藥典種方法與EZ-PCR方法的差異,最后采用卡方檢驗(χ2)來評價
這些方法的檢測限是否存在差異。
7.4.3.方法:將肺炎支原體和口腔支原體分別接種于適宜的培養(yǎng)基中,經(jīng)36℃±1℃培養(yǎng)至
培養(yǎng)基變,盲傳兩代后,將培養(yǎng)物進行10倍稀釋,肺炎支原體取10-7、10-8、10-9、
10-10梯度菌液,口腔支原體取10-3、10-4、10-5、10-6梯度菌液。制成待測供試品。兩
種菌株每個梯度各取1ml菌液分別進行直接培養(yǎng)、指示細胞培養(yǎng)和EZ-PCR,每個培
養(yǎng)做三組平行,結(jié)果記錄如下:(原始記錄見附件三)
菌株
肺炎
支原
體
梯度
10-7
10-8
10-9
10-10
10-3
10-4
10-5
10-6
直接培養(yǎng)法指示細胞法
審核人/日期
EZ-PCR
口腔
支原
體
實驗人/日期
注:對于直接培養(yǎng)法和指示細胞法,“+”表示檢查結(jié)果為陽性,“—”表示檢查結(jié)果
為陰性;對于EZ-PCR,“+”表示在270bp左右有特異性條帶,“—”表示在270bp
左右無特異性條帶。
對結(jié)果進行卡方檢驗分析。
7.4.4.直接培養(yǎng)法操作步驟
7.4.4.1.支原體培養(yǎng)基靈敏度檢查
7.4.4.1.1.操作:將肺炎支原體、口腔支原體接種于適宜的支原體培養(yǎng)基中,經(jīng)36℃±1℃
培養(yǎng)至培養(yǎng)基變,盲傳兩代后,將培養(yǎng)物接種至待檢培養(yǎng)基中,做10倍系列
稀釋,肺炎支原體稀釋至10-7~10-9,接種在支原體肉湯培養(yǎng)基中;口腔支原體稀
釋至10-3~10-5,接種在精氨酸支原體肉湯培養(yǎng)基內(nèi)。每個稀釋度接種3支試管,
置于36℃±1℃培養(yǎng)7~14天,觀察培養(yǎng)基變結(jié)果。(記錄見附件三)
7.4.4.1.2.結(jié)果判定:以接種后培養(yǎng)基管數(shù)的2/3以上呈現(xiàn)變的最高稀釋度為該培養(yǎng)基的
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靈敏度(肺炎支原體應(yīng)達到10-8),口腔支原體應(yīng)達到10-4。
7.4.4.2.檢查法
7.4.4.2.1.操作:供試品如在分裝后24小時以內(nèi)進行支原體檢查者可貯存于2~8℃;超過
24小時應(yīng)置于-20℃貯存。
半流體培養(yǎng)基在使用前應(yīng)煮沸10~15分鐘,冷卻至56℃左右,然后加入滅能小牛
血清(培養(yǎng)基:血清為8:2),并可酌情加入適量青霉素,充分搖勻。液體培養(yǎng)基
除無需煮沸外,使用前亦應(yīng)同樣補加上述成分。
取每只裝量為10ml的支原體液體培養(yǎng)基各4支、相應(yīng)的支原體半流體培養(yǎng)基各2
支,每只培養(yǎng)基接種供試品1,置36℃±1℃培養(yǎng)21天。于接種后的第7天從4
支支原體液體培養(yǎng)基中各取2支進行次代培養(yǎng),每支培養(yǎng)基分別轉(zhuǎn)種至相應(yīng)的支
原體半流體培養(yǎng)基及支原體液體培養(yǎng)基各2支,置36℃±1℃培養(yǎng)21天,每隔3
天觀察1次。(記錄見附件三)
7.4.4.2.2.結(jié)果判定:培養(yǎng)結(jié)束時,如接種供試品的培養(yǎng)基均無支原體生長,則供試品判為
合格;如疑有支原體生長,可取加倍量供試品復(fù)試,如無支原體生長,供試品判
斷為合格,如仍有支原體生長,則供試品判為不合格。
7.4.5.指示細胞培養(yǎng)法步驟
7.4.5.1.預(yù)處理
7.4.5.1.1.指示細胞:取培養(yǎng)的Vero細胞經(jīng)消化后,制成每1ml含105的細胞懸液,以每孔
0.5ml接種6孔細胞培養(yǎng)板,每孔再加無抗生素培養(yǎng)基3ml,于5%二氧化碳孵箱
中36℃±1℃培養(yǎng)過夜,備用。
7.4.5.1.2.測定法:于制備好的指示細胞培養(yǎng)板中加入支原體菌懸液1ml,置5%二氧化碳
孵箱36℃±1℃培養(yǎng)3~5天。指示細胞培養(yǎng)物至少傳代一次,末次傳代培養(yǎng)用含
蓋玻片的6孔培養(yǎng)3~5天后,吸出培養(yǎng)孔中的培養(yǎng)液,加入固定液5ml,放置5
分鐘,吸出固定液,再加5ml固定液固定10分鐘,吸出固定液,使蓋玻片在空
氣中干燥,加二苯甲酰胺熒光染料工作液5ml,加蓋,室溫放置30分鐘,吸出染
液,每孔用水5ml洗3次,吸出水,蓋玻片于空氣中干燥,取潔凈載玻片加封片
液1滴,分別將蓋玻片面向下蓋在封片液上制成封片。用熒光顯微鏡觀察。用無
抗生素培養(yǎng)基1ml代替支原體菌懸液,同法操作,作為陰性對照。
取稀釋梯度為10-2的肺炎支原體和口腔支原體混合液1ml代替支原體菌懸液作為
陽性對照。(結(jié)果記錄于附件三)。
7.4.5.2.結(jié)果判定
7.4.5.2.1.陰性對照:僅見指示細胞的細胞核呈現(xiàn)黃綠熒光。
7.4.5.2.2.陽性對照:熒光顯微鏡下除細胞外,可見大小不等、不規(guī)則的熒光著顆粒。
當(dāng)陰性及陽性對照結(jié)果均成立時,試驗有效。
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如果供試品為陰性,則供試品判為合格;如供試品結(jié)果為陽性或可疑時,應(yīng)進行
重試;如仍為陽性時,供試品判為不合格。
7.5.重現(xiàn)性驗證
7.5.1.定義:重現(xiàn)性是指相同的樣品在正常的實驗條件(如實驗地點、實驗人員、儀器、
試劑的批次等)發(fā)生變化時,所得檢驗結(jié)果的精密度。
7.5.2.說明:在待測樣品中接種稀釋梯度為10-2的口腔支原體和肺炎支原體混合菌懸液1ml,
采用直接培養(yǎng)法、指示細胞法和EZ-PCR,分別由三個同事在不同的時間使用不同的
PCR儀進行檢驗,最后采用卡方檢驗(χ2)來評價這些種方法的檢測限是否存在差
異。
7.5.3.方法:
7.5.3.1.供試液制備:取細胞制備過程中細胞上清液作為檢測樣品,每次檢驗量為1ml,另
加入稀釋梯度為10-2的口腔支原體和肺炎支原體混合菌懸液1ml,因此總體積為
2ml,細胞上清取樣后置于-20℃保存。
7.5.3.2.直接培養(yǎng)法、指示細胞法和EZ-PCR方法如前所述。
7.5.3.3.第一次試驗:分別由同事A、同事B、同事C在相同實驗條件下使用PCR儀○1進
行實驗,每次做10個平行,結(jié)果記錄如下表:(原始記錄見附件四)
第一次試驗(PCR儀○1)
名稱
同事A
直接培養(yǎng)法指示細胞法EZ-PCR
同事B
同事C
實驗人/日期審核人/日期
注:對于直接培養(yǎng)法和指示細胞法,“+”表示檢查結(jié)果為陽性,“—”表示檢查結(jié)果
為陰性;對于EZ-PCR,“+”表示在270bp左右有特異性條帶,“—”表示在270bp
左右無特異性條帶。
7.5.3.4.第二次試驗:一周后,分別由同事A、同事B、同事C在相同實驗條件下使用PCR
儀○2進行實驗,每次做10個平行,結(jié)果記錄如下表:(原始記錄見附件五)
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YCJ制
第二次試驗(PCR儀○2)
名稱
同事A
直接培養(yǎng)法指示細胞法EZ-PCR
同事B
同事C
實驗人/日期審核人/日期
注:對于直接培養(yǎng)法和指示細胞法,“+”表示檢查結(jié)果為陽性,“—”表示檢查結(jié)果
為陰性;對于EZ-PCR,“+”表示在270bp左右有特異性條帶,“—”表示在270bp
左右無特異性條帶。
7.5.3.5.第三次試驗:兩周后,分別由同事A、同事B、同事C在相同實驗條件下使用PCR
儀○3進行實驗,每次做10個平行,結(jié)果記錄如下表:(原始記錄見附件六)
第三次試驗(PCR儀○3)
名稱
同事A
直接培養(yǎng)法指示細胞法EZ-PCR
同事B
同事C
實驗人/日期審核人/日期
注:對于直接培養(yǎng)法和指示細胞法,“+”表示檢查結(jié)果為陽性,“—”表示檢查結(jié)果
為陰性;對于EZ-PCR,“+”表示在270bp左右有特異性條帶,“—”表示在270bp
左右無特異性條帶。
7.5.4.結(jié)果分析:對上述結(jié)果進行卡方檢驗,評價方法間的差異。
對每次PCR的結(jié)果進行統(tǒng)計分析,對重現(xiàn)性進行評價。
7.6.耐用性驗證
7.6.1.定義:耐用性是指當(dāng)方法參數(shù)有小的刻意變化時,檢驗結(jié)果不受影響的能力,為方
法正常使用時的可靠性提供依據(jù)。
7.6.2.說明:本次耐用性對樣品存儲溫度、存儲時間、樣品加樣量進行驗證。
7.6.3.方法:
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7.6.3.1.存儲溫度耐用性驗證:取細胞培養(yǎng)上清液,加入適量支原體菌懸液,配制成已知支
原體陽性細胞培養(yǎng)上清液。第一組于4℃保存0天(即取即檢)、2天、7天、15
天后分別取樣進行EZ-PCR檢驗;第二組于-20℃保存0天(即取即檢)、2天、7
天、15天后分別取樣進行EZ-PCR檢驗;每次檢驗做5組平行,結(jié)果記錄如下表:
(原始電泳圖見附件七)
組號平行
陰性對照
陽性對照
1
第一組2
3
4
5
陰性對照
陽性對照
1
第二組2
3
4
5
實驗人/日期
0天2天后
審核人/日期
7天后15天后
注:陰性對照結(jié)果為“—”(即不特異性條帶),陽性對照結(jié)果為“+”(即有特異
性條帶)時,試驗結(jié)果方有效。
7.6.3.2.加樣量耐用性驗證:取已知支原體陽性細胞培養(yǎng)上清液進行EZ-PCR,其中樣品量
分別加1ul、3ul、5ul、6ul,其余用無菌水補齊,每組做5個平行,結(jié)果記錄如下
表:(原始電泳圖見附件八)
平行
陰性對照
陽性對照
1
2
3
4
5
1ul3ul5ul6ul
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試驗人/日期審核人/日期
注:陰性對照結(jié)果為“—”(即不特異性條帶),陽性對照結(jié)果為“+”(即有特異
性條帶)時,試驗結(jié)果方有效。
7.6.4.耐用性驗證結(jié)果分析:經(jīng)過對存儲溫度,存儲時間及加樣量的耐用性驗證,可初步
判斷EZ-PCR檢測支原體污染的耐用性程度,同時也可初步確定樣品存儲溫度、存
儲時間及加樣量的誤差允許范圍,為后續(xù)實驗提供參考。
8.驗證結(jié)果分析
9.驗證評價
10.驗證結(jié)論
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