貓泛白細胞減少癥、杯狀、皰疹、冠狀病毒、血巴爾通體PCR檢測方法
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DBXX/XXXXX—XXXX
10報告
根據(jù)檢測結(jié)果,出具報告。
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DBXX/XXXXX—XXXX
附錄A
(規(guī)范性附錄)
貓泛白細胞減少癥病毒、杯狀病毒、皰疹1型病毒的多重PCR檢測
采用PCR方法,特異性擴增貓泛白細胞減少癥病毒(FPV)的NS基因序列、貓杯狀病毒(FCV)的ORF2
基因序列以及貓1型皰疹病毒(FHV-I)的TK基因序列,用于貓泛白細胞減少癥病毒、杯狀病毒、皰疹1
型病毒的多重檢測。
A.1RNA和DNA的提取
按照試劑盒說明書分別提取病毒RNA和DNA。將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。將提取的DNA和反轉(zhuǎn)
得到的cDNA于-20℃保存、備用。
A.2PCR反應(yīng)
以FCV的cDNA和FPV、FHV-I的DNA混合物作為多重PCR的模板進行PCR擴增,擴增
引物見表1,PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s、55℃退火30s、72℃延伸1min,
30個循環(huán);72℃10min。
表A.1
Primers
FPV
多重PCR引物序列
Length
392bp
Sequences(5'-3')
ATGGTTGGTGACTCTTTGTTT
TACATTTGATTGACACTTCCC
FCVAACCTGCGCTAACGTGCTT
CAGTGACAATACACCCAGAA
922bp
FHV-IGACGTGGTGAATTATCAG
CAACTAGATTTCCACCAGG
290bp
A.3PCR產(chǎn)物
1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。
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附錄B
(規(guī)范性附錄)
貓冠狀病毒RT-PCR檢測方法
采用RT-PCR方法,特異性擴增貓冠狀病毒ORF1b基因片段,用于貓冠狀病毒的檢測。
B.1病毒RNA的提取和cDNA第一鏈的合成
按照病毒RNA提取試劑盒操作方法進行RNA的提取,按照cDNA第一鏈合成試劑盒操作方法將
RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,得到的cDNA于-20℃保存、備用。
B.2PCR反應(yīng)引物
上游引物序列(5’-3’):GTGATGCTATCATGACTAG
下游引物序列(5’-3’):CACCATTACAACCTTCTAA
B.3PCR反應(yīng)條件
95℃預(yù)變性2min;95℃變性30s,48℃退火35s,72℃延伸45s,30個循環(huán);72℃延伸5min。
B.4PCR產(chǎn)物
PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,目的片段大小為417bp。
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附錄C
(規(guī)范性附錄)
貓白血病病毒巢式RT-PCR檢測方法
采用巢式RT-PCR方法,特異性擴增貓白血病病毒基因片段,用于貓白血病病毒的檢測。
C.1病毒RNA的提取和cDNA第一鏈的合成
按照病毒RNA提取試劑盒操作方法進行RNA的提取,按照cDNA第一鏈合成試劑盒操作方法將
RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,得到的cDNA于-20℃保存、備用。
C.2
C.2.1
PCR反應(yīng)引物
第一次反應(yīng)引物
上游引物序列(5’-3’):ACAGCAGAAGTTTCAAGGCC
下游引物序列(5’-3’):GACCAGTGATCAAGGGTGAG
C.2.2第二次反應(yīng)引物
上游引物序列(5’-3’):GCTCCCCAGTTGACCAGAGT
下游引物序列(5’-3’):GCTTCGGTACCAAACCGAAA
C.3
C.3.1
PCR反應(yīng)
第一次PCR反應(yīng)
以制備的cDNA為模板,進行第一次PCR反應(yīng),條件如下:95℃預(yù)變性2min;95℃變性45s,58℃
退火30s,72℃延伸1min,35個循環(huán);72℃延伸7min。
C.3.2第二次PCR反應(yīng)
以第一次PCR產(chǎn)物為模板,進行第二次PCR反應(yīng),條件如下:95℃預(yù)變性2min;95℃變性45s,
58℃退火30s,72℃延伸1min,35個循環(huán);72℃延伸7min。
C.4PCR產(chǎn)物
PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,目的片段大小為601bp。
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DBXX/XXXXX—XXXX
附錄D
(規(guī)范性附錄)
貓免疫缺陷病毒巢式RT-PCR檢測方法
采用巢式RT-PCR方法,特異性擴增貓免疫缺陷病毒pol基因片段,用于貓免疫缺陷病毒的檢測。
D.1病毒RNA的提取和cDNA第一鏈的合成
按照病毒RNA提取試劑盒操作方法進行RNA的提取,按照cDNA第一鏈合成試劑盒操作方法將
RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,得到的cDNA于-20℃保存、備用。
D.2
D.2.1
PCR反應(yīng)引物
第一次反應(yīng)引物
上游引物序列(5’-3’):TGGCCWYTAWCWAATGAAAARATWGAAGC
下游引物序列(5’-3’):GTAATTTRTCTTCHGGNGTYTCAAATCCCC
D.2.2第二次反應(yīng)引物
上游引物序列(5’-3’):TGAAAARATWGAAGCHTTAACAGAMATAG
下游引物序列(5’-3’):GTAATTTRTCTTCHGGNGTYTCAAATCCCC
D.3
D.3.1
PCR反應(yīng)
第一次PCR反應(yīng)
以制備的cDNA為模板,進行第一次PCR反應(yīng),條件如下:95℃預(yù)變性2min;95℃變性45s,58℃
退火30s,72℃延伸1min,35個循環(huán);72℃延伸7min。
D.3.2第二次PCR反應(yīng)
以第一次PCR產(chǎn)物為模板,進行第二次PCR反應(yīng),條件如下:95℃預(yù)變性2min;95℃變性45s,
58℃退火30s,72℃延伸1min,35個循環(huán);72℃延伸7min。
D.4PCR產(chǎn)物
PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,目的片段大小為578bp。
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DBXX/XXXXX—XXXX
附錄E
(規(guī)范性附錄)
貓血巴爾通體PCR檢測方法
采用PCR方法,特異性擴增貓血巴爾通體16SrDNA基因片段,用于貓血巴爾通體的檢測。
E.1DNA的提取
按照DNA提取試劑盒操作方法進行,提取的DNA于-20℃保存、備用。
E.2PCR反應(yīng)引物
上游引物序列(5’-3’):TCACAATGGACGAAAGTCTG
下游引物序列(5’-3’):CCAAACATCTCAAGACACGAG
E.3PCR反應(yīng)
以提取的DNA為模板,進行PCR反應(yīng),條件如下:
95℃預(yù)變性2min;95℃變性15s,55℃退火30s,72℃延伸1min,35個循環(huán);72℃延伸5min。
E.4PCR產(chǎn)物
PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,目的片段大小為711bp。
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