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      沙漠野狗桑迪馬利基贏得了世界上最有趣的基因組競賽

      一只野生的,純正的澳大利亞沙漠野狗叫桑迪馬利基,在世界上最有趣的基因組競賽中名列第一。新南威爾士大學領(lǐng)導的桑迪DNA解碼的提議是太平洋生物科學SMRT格蘭特的五個入圍者之一,提供切割 - 特別迷人的植物或動物的完整基因組的邊緣測序。

      沙漠野狗桑迪馬利基贏得了世界上最有趣的基因組競賽

      公眾確定了獲勝者,兩歲的桑迪獲得了41%的國際社區(qū)選票,緊隨其后的是一只Temple Pitviper蛇,一只太陽能海底船,一只爆炸性的轟炸機甲蟲和一只粉紅色的鴿子。

      新南威爾士大學生物技術(shù)與生物分子科學學院的項目負責人比爾巴拉德教授說:“我們很高興我們讓桑迪的DNA序列獲得了公眾的想象。”

      “Sandy真的是科學的天賦。作為一種罕見的,野生的純野狗,她提供了一個獨特的案例研究。純野狗介于野狼和家犬之間,具有一系列非馴化特性。因此對桑迪的基因組進行測序?qū)椭_定一些基因的氣質(zhì)和行為,這些基因是從野生動物到完美寵物過渡的基礎。

      “同樣,通過開發(fā)改進的野狗純度測試,學習更多關(guān)于野狗遺傳學將有助于保護這些美妙的澳大利亞動物,”巴拉德教授說。

      2014年,桑迪和她的姐姐和兄弟被澳大利亞動物愛好者Barry和Lyn Eggleton在Strzelecki Track附近的澳大利亞沙漠中發(fā)現(xiàn)為三周大的幼崽,他們從此手工飼養(yǎng)過它們。幼崽接近死亡,無法找到他們的父母。

      該野狗測序項目將率先試查爾斯達爾文1868年的理論,馴化過程可以分為兩個步驟:無意識選擇非故意人為影響的結(jié)果;人工選擇是人類繁殖所需特性的結(jié)果。

      “這個項目將揭示狼和野狗(無意識選擇)和野狗和狗(人工選擇)之間的DNA變化,”巴拉德教授說。

      年度國際PacBio競賽的一個主要目標是提高公眾對科學的認識以及基因組研究如何使社會受益,該競賽今年吸引了200多個參賽者。Sandy的團隊設立了DancingwithDingoes Facebook頁面,獲得了世界各地人們的支持,包括動物保護主義者和狼,野狗和狗的粉絲。

      “我們還與新南威爾士大學的工作人員和學生們進行了接觸,將兩只來自Bargo Dingo Sanctuary的純高山野狗帶到校園里供大家見面,”Ballard教授說。

      最先進的PacBio技術(shù)允許DNA在含有數(shù)萬個堿基的長切片中進行測序,而不是像現(xiàn)有技術(shù)那樣在幾百個堿基的較短切片中測序。這可以揭示基因組中影響基因表達的重要重排。

      測序?qū)⒃趤喞D谴髮W進行,并由Computomics在德國進行初步分析。

      Sandy項目背后的澳大利亞團隊還包括悉尼大學的Claire Wade教授,新南威爾士大學的Richard Melvin博士,葡萄園獸醫(yī)醫(yī)院的Robert Zammit博士和Garvan醫(yī)學研究所的Andre Minoche博士。

      新南威爾士大學在基因組學研究方面享有盛譽,該大學的Ramaciotti基因組學中心的科學家們研究了各種其他重要的本土生物的基因組,包括考拉,塔斯馬尼亞惡魔,袋熊,鴨嘴獸,昆士蘭果蠅。和Wollemi Pine。

      新南威爾士大學分子生物學家兼副校長(教育)教授梅林克羅斯利說:“我們?yōu)樾履贤柺看髮W對基因組學貢獻的歷史感到非常自豪,我們很高興桑迪的基因組現(xiàn)在將被列為贏得這項競賽的獎項。”

      “澳大利亞有許多有趣的動物進行測序,結(jié)果增強了我們對進化和生物學的理解,并有助于改善農(nóng)業(yè)和蟲害管理”。

      有關(guān)Sandy Maliki及其兄弟姐妹Eggie Warrigal和Didi Mirigung的更多信息,請參閱他們的Pure Dingo Facebook頁面。

      Dingoes大約5000年前被引入澳大利亞。人們普遍認為他們沒有被澳大利亞土著居民馴化。純野狗變得越來越稀少,因為本地動物與野狗和家犬雜交,并且被土地所有者作為害蟲。

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