新的組蛋白修飾將代謝與基因活性結(jié)合起來
HelmholtzZentrumMünchen和Ludwig-Maximilians-UniversitätMunichy(慕尼黑大學(xué))的科學(xué)家發(fā)現(xiàn),兩種新的組蛋白修飾將細(xì)胞代謝與基因活動聯(lián)系起來。該研究發(fā)表在Nature Structural and Molecular Biology上。
DNA被包裹在稱為組蛋白的蛋白質(zhì)周圍,用于將DNA包裝在細(xì)胞核內(nèi),并在調(diào)節(jié)基因表達(dá)中發(fā)揮重要作用。組蛋白可以用小化學(xué)基團(tuán)修飾,其中許多是細(xì)胞代謝產(chǎn)物。通過損害或增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄,這些修飾能夠影響基因活性。
雖然這可能提供一種潛在的機(jī)制,通過這種機(jī)制,我們的環(huán)境 - 例如我們吃的食物 - 可以導(dǎo)致基因表達(dá)的變化,但尚不清楚組蛋白標(biāo)記是如何與細(xì)胞代謝真正結(jié)合以及這可能如何影響染色質(zhì)組織和基因活性。
在這項研究中,來自HelmholtzZentrumMünchen和LMU的功能表觀遺傳學(xué)研究所(IFE)的Robert Schneider團(tuán)隊研究了兩種新的修飾,丙?;投□;?即在組蛋白中加入丙?;投□;?。研究人員發(fā)現(xiàn),丙?;投□;纱嬖谟诮M蛋白H3上,特別是賴氨酸殘基14(H3K14)。
丙酸鹽和丁酸鹽是脂肪酸代謝的產(chǎn)物
根據(jù)該研究,這些修飾特異性地標(biāo)記高度表達(dá)的基因,并且它們的存在在代謝改變時發(fā)生變化,例如在禁食時。研究人員還表明,組蛋白丙酰化可以驅(qū)動試管中的轉(zhuǎn)錄(體外),這表明它是一種刺激性標(biāo)記,能夠在基因存在時使其表達(dá)。“有趣的是,丙酸和丁酸是脂肪酸代謝的產(chǎn)物”,Robert Schneider解釋說。“這意味著這些組蛋白修飾可能是細(xì)胞代謝狀態(tài)與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)相關(guān)聯(lián)的一種方式。”
組蛋白修飾引發(fā)生物反應(yīng)的一種方式是通過特定蛋白質(zhì),即所謂的“讀者”識別。結(jié)合使用下拉分析和質(zhì)譜分析,該團(tuán)隊確定了這些新標(biāo)記的特定讀取蛋白。響應(yīng)于脂肪酸代謝和讀取蛋白結(jié)合而添加這些標(biāo)記會改變?nèi)旧|(zhì)的特征,從而改變其功能狀態(tài)。施奈德說:“這些結(jié)果對代謝性疾病,如糖尿病和肥胖癥尤其重要。”“我們現(xiàn)在的目標(biāo)是研究這些新基因開關(guān)在疾病模型中的作用。”
結(jié)果表明組蛋白丙酰化可能在代謝信號傳導(dǎo)和疾病中起作用,因為丙酰輔酶A羧化酶(降解該輔因子的酶)與代謝疾病有關(guān)并且實際上改變組蛋白丙酰化。
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