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      科學家已經(jīng)解開了馴鹿的基因組
      
			
      
				2019-05-19 14:22:19
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      隨著萬圣節(jié)的結束，今天傳統(tǒng)上是圣誕節(jié)裝飾品出現(xiàn)的那一天，因此與節(jié)日相關的標志性動物通過加入物種清單以對其進行基因組測序來獲得節(jié)日精神的跳躍是恰當?shù)?。今天在開放獲取期刊GigaScience上發(fā)表，是一篇描述馴鹿基因組測序和分析的文章。這項工作盡管不太可能揭示圣誕老人的馴鹿可以飛行的原因，但它為進一步了解進化，馴化，畜牧業(yè)和適應極端環(huán)境的過程提供了巨大的資源。
      

      科學家已經(jīng)解開了馴鹿的基因組
      

      馴鹿(Rangifer tarandus)是鹿或Cervid家族中唯一完全馴化的物種。它也是世界上唯一分布的鹿：跨越北亞，北美和歐洲的北方，苔原，亞北極，北極和山區(qū)。與所有其他的鹿不同，它不僅是生長和脫落鹿角的雄鹿，也是雌性。來自畜牧業(yè)從觀點來看，馴鹿牛奶的蛋白質含量更高，乳糖含量低于牛奶。鑒于世界上乳糖不耐受人群的百分比很高，后一方面使得這種牛奶的可用性成為可能。憑借這些獨特的功能，馴鹿基因組序列的可用性可以提供完整的雪橇充滿新信息，并且是馴化物種的精英俱樂部的受歡迎的新成員，其具有參考基因組，包括牛，綿羊和山羊。
      

      這項工作由長春中國農(nóng)業(yè)科學院和西安西北工業(yè)大學的中國研究人員組成。研究人員從中國大興安嶺的游牧鄂溫克族獵人牧民飼養(yǎng)的兩頭雌性馴鹿中采集了一份血樣。他們對基因組進行了測序，組裝和注釋，并證明它具有高質量。馴鹿基因組與相關物種和人類基因組的比較顯示，馴鹿基因組大小(2.6 GB或26億堿基對)略小于人類，牛和山羊，大小與綿羊大小相同。
      

      該論文的第一作者，中國農(nóng)業(yè)科學院特種動植物科學研究所副教授李哲平指出，該分析還確定了“335馴鹿特異性基因可能有助于了解特殊的生物學特性在馴鹿和其他反芻動物之間的未來比較基因組學研究中，這些對于了解馴鹿以及整個Cervid家族的進化也非常有用。“
      

      考慮到這一目標，研究人員還利用新的基因組和牛家族成員已有的基因組構建了一個進化樹。他們發(fā)現(xiàn)大約2960萬年前馴鹿，牛和山羊與共同祖先分開。這是在漸新世時期，其中一個主要變化是草原的全球擴張。
      

      本文是首屆GigaScience競賽和獎項賽道的獲獎者之一，該賽道用于推廣新的，前沿的研究。作者在BGI第12屆年度基因組學國際會議的特別會議上介紹了他們的工作10月27日星期五在深圳。作為一項開放科學競賽，本次和其他獲獎者的文章以完全開放的方式進行了審查，公眾可以在Biorxiv預打印服務器上公開提供該條草案的整個出版過程，完成同行評審過程在學術卡瑪覆蓋審查系統(tǒng)的出版決定之前提供評論，然后是編輯決定，稿件修訂和文章發(fā)布，所有編輯，作者和評論者的信件都與已發(fā)表的文章一起提供。
      
			

			
        
      
			
      
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