異染色質(zhì)驅(qū)動倒置核和常規(guī)核的區(qū)室化
哺乳動物細(xì)胞的細(xì)胞核顯示基因組中的活性常染色質(zhì)和異染色質(zhì)非活性區(qū)域的不同的空間隔離1,2。在傳統(tǒng)的核,顯微鏡顯示常染色質(zhì)在核內(nèi),并在異核周局部1,2。全基因組染色體構(gòu)象捕獲(Hi-C)分析顯示這種分離作為常染色質(zhì)和異染色質(zhì)區(qū)室3內(nèi)的接觸富集的格子圖案,以及它們之間的消耗。對于隔室的形成許多機制已被提出,如異染色質(zhì)的吸引力核纖層2,4,類似的染色質(zhì)的優(yōu)先吸引到彼此1,4,5,6,7,8,9,10,11,12,在活性染色質(zhì)更高水平的染色質(zhì)遷移率的13,14,15和常染色質(zhì)的轉(zhuǎn)錄相關(guān)的聚類16,17。
然而,這些假設(shè)仍然沒有定論,因為在常規(guī)細(xì)胞核中很難解開染色質(zhì)內(nèi)和染色質(zhì) - 層板相互作用18。相間染色體在桿的反相細(xì)胞核標(biāo)記重組夜間哺乳動物19,20提供了闡明空間劃分背后的機制的機會。在這里,我們結(jié)合倒桿核的Hi-C分析與顯微鏡和聚合物模擬。我們發(fā)現(xiàn),異染色區(qū)域之間的吸引力對于建立區(qū)室化以及倒置核中的pericentromeric異染色質(zhì),兼性異染色質(zhì)和常染色質(zhì)的同心殼是至關(guān)重要的。當(dāng)添加異染色質(zhì)和椎板之間的相互作用時,相同的模型重建了傳統(tǒng)的核組織。此外,我們的模型允許我們排除涉及強烈的常染色質(zhì)相互作用的區(qū)室化機制。一起,
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