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      用多組學(xué)方法改善結(jié)腸癌治療
      
			
      
				2019-04-26 09:54:58
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      在今天發(fā)表在Cell上的一項(xiàng)研究中，貝勒醫(yī)學(xué)院的研究人員對(duì)人類結(jié)腸癌組織進(jìn)行了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析。他們的研究強(qiáng)烈支持腫瘤組織的全面表征，作為指導(dǎo)進(jìn)一步研究的手段，從而導(dǎo)致早期診斷策略和新療法。
      

      用多組學(xué)方法改善結(jié)腸癌治療
      

      在生成基因組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)后，該團(tuán)隊(duì)使用生物信息學(xué)進(jìn)行分析。結(jié)果是結(jié)腸癌腫瘤和鄰近正常組織產(chǎn)生的不同蛋白質(zhì)的第一個(gè)系統(tǒng)目錄。
      

      “我們不僅能夠確認(rèn)先前描述的結(jié)腸癌分子標(biāo)志物，還能夠揭示腫瘤和正常組織產(chǎn)生的蛋白質(zhì)之間的新差異，這可能值得進(jìn)一步研究，”資深作者張兵說。
      

      研究人員還發(fā)現(xiàn)，基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)的結(jié)合極大地提高了他們對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞的認(rèn)識(shí)。
      

      進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析提出了對(duì)基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)(如SOX9實(shí)例)之間明顯矛盾的可能解釋。“一個(gè)例子是SOX9，”張說。“我們的基因組數(shù)據(jù)集表明，SOX9是一種腫瘤抑制基因，因?yàn)樗?jīng)常在結(jié)腸癌中發(fā)生突變，這種方式表明該基因編碼的蛋白質(zhì)的功能會(huì)被破壞，并且蛋白質(zhì)不會(huì)在較小的蛋白質(zhì)中產(chǎn)生或產(chǎn)生。量。但是，當(dāng)我們觀察蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù) - 癌癥組織中的實(shí)際蛋白質(zhì)時(shí) - 我們觀察到相反的情況;SOX9蛋白在這些腫瘤中非常豐富，比正常情況更多。因此，蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)挑戰(zhàn)了SOX9是腫瘤抑制因子的跡象。“
      

      “對(duì)基因的分析告訴我們可能出現(xiàn)的問題。但是，在我們分析蛋白質(zhì)之前，我們并不確切地知道究竟出了什么問題，“太平洋西北國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的合著者劉濤說。
      

      研究人員使用名為L(zhǎng)inkedOmics的網(wǎng)絡(luò)工具訪問了所有數(shù)據(jù)，該工具還為進(jìn)一步探索該數(shù)據(jù)集提供了計(jì)算工具。
      
			

			
        
      
			
      
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