突變和3-D建模揭示了細(xì)胞分裂過程的新結(jié)構(gòu)
細(xì)胞分裂是生物學(xué)最基本的過程之一。它使所有生物都能夠成長,繁衍并形成復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。但是科學(xué)家仍然不了解這個過程背后的許多細(xì)節(jié)。
在細(xì)胞分裂之前,它會為每個染色體制作兩個拷貝。這些副本稱為姐妹染色單體,與細(xì)胞核的相對兩端對齊并分離,這樣一整套就會伴隨著將要形成的兩個子細(xì)胞。在美國國家科學(xué)院院刊(PNAS)上發(fā)表的一項新研究中,沖繩科學(xué)技術(shù)研究生院(OIST)的研究人員正在挑戰(zhàn)這一過程如何運(yùn)作的一個關(guān)鍵方面。
該研究的重點是一種叫做cohesin的蛋白質(zhì)復(fù)合物,它的任務(wù)是將姐妹染色單體保持在一起,直到細(xì)胞開始分裂,然后在細(xì)胞分裂并且染色體必須分開時松開。大多數(shù)研究人員認(rèn)為cohesin的形狀像一個環(huán),通過環(huán)繞染色單體將染色單體結(jié)合在一起。但對于Drs。由Yanuida Mitsuhiro教授領(lǐng)導(dǎo)的OIST G0細(xì)胞科的Xingya Xu和Norihiko Nakazawa,這個模型的某些方面沒有加起來。
Cohesin在一種名為Cut1的酶的幫助下釋放染色質(zhì)。染色質(zhì)是由DNA和蛋白質(zhì)組成的大量遺傳物質(zhì),在真核細(xì)胞分裂過程中凝聚形成染色體。當(dāng)染色體排列后,Cut1酶破壞開放的cohesin,使兩個染色單體分離成子細(xì)胞。當(dāng)研究人員在裂殖酵母細(xì)胞中突變編碼Cut1的基因時,細(xì)胞分裂周期就像預(yù)期的那樣崩潰,因為突變的Cut1無法打開環(huán)狀的cohesin。然而,理論上,正常的細(xì)胞分裂可以通過添加第二個突變來恢復(fù),該第二個突變就像第一個突變的撤消按鈕一樣,允許酶再次破壞開放的粘連,打開環(huán)。
當(dāng)他們將這第二個突變添加到他們的裂殖酵母細(xì)胞時,這不是團(tuán)隊所看到的。相反,攜帶這兩種突變的細(xì)胞仍然無法分解cohesin。因為Cut1酶需要cohesin的假定環(huán)結(jié)構(gòu)才能正常運(yùn)作,所以科學(xué)家們開始認(rèn)為cohesin沒有研究人員長期以來認(rèn)為的環(huán)形。
“我們感到很驚訝,”Nakazawa博士說,“因為如果cohesin就像染色質(zhì)周圍的環(huán),那么染色單體應(yīng)該被第二次突變切斷。”他補(bǔ)充說,事實并非如此,這表明cohesin可能有不同的結(jié)構(gòu)。
Yanagida教授團(tuán)隊在2003年的先前研究中使用極高分辨率顯微鏡(原子力顯微鏡(AFM))檢查了原子水平下cohesin結(jié)構(gòu)的某些方面,但這些結(jié)果并沒有揭示該復(fù)合物的所有細(xì)節(jié)。形狀。為了獲得更好的圖片,OIST團(tuán)隊不得不關(guān)注遺傳學(xué)。
科學(xué)家們首先對裂殖酵母細(xì)胞中凝聚力的全基因組進(jìn)行測序,以確定蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的區(qū)域發(fā)生突變的位置,以及這些突變?nèi)绾斡绊慶ohesin復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。這些突變出現(xiàn)在被稱為“頭部”和“鉸鏈”的cohesin區(qū)域,它將蛋白質(zhì)復(fù)合物的兩個主要單元固定在一起。它們被認(rèn)為是在環(huán)結(jié)構(gòu)的相對側(cè),但是對于cohesin本身的進(jìn)一步基因組分析表明它們可能彼此相鄰,這將使得cohesin的環(huán)配置不太可能。
Yanagida教授,徐博士和Nakazawa博士提出了一種新模型,稱為保持和釋放,其中cohesin更像是一個將染色單體保持在適當(dāng)位置的下顎,然后打開以允許染色質(zhì)移動,而不需要Cut1打破打開復(fù)雜的。
基于cohesin頭部和鉸鏈的序列,研究人員構(gòu)建了蛋白質(zhì)復(fù)合物的三維計算機(jī)模型。該模型由東京大學(xué)的Ryuta Kanai博士和Chikashi Toyoshima教授創(chuàng)建,表明OIST裂殖酵母研究中的第二個突變不能破壞cohesin - 支持他們在裂殖酵母中的觀察結(jié)果并添加更多證據(jù)表明復(fù)雜的不是環(huán)形的。
新模型很好地適應(yīng)了舊研究中cohesin的AFM圖像,這表明該分子的長度是預(yù)期環(huán)結(jié)構(gòu)的一半,并且cohesin是“蝌蚪形狀” - 一端較大并且逐漸變細(xì)至較薄,對面。
Nakazawa博士和Xu博士仍然沒有足夠的證據(jù)來確定凝聚力的形狀。他們還不知道cohesin如何與染色質(zhì)結(jié)合以將其固定到位以及是否需要單個復(fù)合物或一對復(fù)合物。隨著團(tuán)隊探索這些可能性,他們可能更接近于證明他們的新理論 - 甚至可能更好地理解由異常細(xì)胞分裂引起的疾病。
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