加拿大lynx基因組的首次測(cè)序
馬薩諸塞州阿默斯特大學(xué)的科學(xué)家本周與紐約脊椎動(dòng)物基因組實(shí)驗(yàn)室(VGL)合作,發(fā)布了加拿大ly((Lynx canadensis)的首個(gè)全基因組。據(jù)麻省大學(xué)阿默斯特分校環(huán)境保護(hù)博士候選人坦尼亞喇嘛協(xié)調(diào)員Tanya Lama說(shuō),它是14個(gè)被發(fā)布到公共數(shù)據(jù)庫(kù)供研究進(jìn)化,疾病,遺傳和保護(hù)的研究人員之一。
研究人員將于9月12日星期三在紐約洛克菲勒大學(xué)的VGL召開(kāi)新聞發(fā)布會(huì),宣布基因組發(fā)布。
同樣隸屬于美國(guó)地質(zhì)調(diào)查局馬薩諸塞州合作魚(yú)類(lèi)和野生動(dòng)物研究部門(mén)的喇嘛說(shuō),作為一種保護(hù)遺傳工具,該基因組提供了有關(guān)該物種的遺傳健康,人口統(tǒng)計(jì)學(xué)和進(jìn)化史的信息。它還有助于使用對(duì)真實(shí)世界景觀(guān)的種群大小,基因流和適應(yīng)性遺傳變異的精確估計(jì)來(lái)描述常駐動(dòng)物的生存能力。她補(bǔ)充說(shuō),這些信息對(duì)野生動(dòng)物管理和政策決定至關(guān)重要。
特別是,她和同事們希望更多地了解緬因州lyin與新不倫瑞克省和魁北克省的鄰近人口之間的關(guān)系,以及他們與加拿大東部核心ly people種群之間的關(guān)系,這是“強(qiáng)大的障礙”,即圣勞倫斯河。
喇嘛指出,“遺傳學(xué)可以幫助我們更好地了解緬因州lynx種群的動(dòng)態(tài)以及它是否能夠在未來(lái)保持活力。如果種群變得小而孤立,它們更容易受到人口和環(huán)境變化的影響而且更高成為當(dāng)?shù)亟^種的風(fēng)險(xiǎn)。“
加拿大ly is于2000年被美國(guó)魚(yú)類(lèi)和野生動(dòng)物管理局列為威脅,是一種北美貓科動(dòng)物,原產(chǎn)于加拿大北部的北方森林和美國(guó)北部的類(lèi)似棲息地,尤其是緬因州。美國(guó)魚(yú)類(lèi)和野生動(dòng)物管理局最近的一項(xiàng)建議是,建議將瀕臨滅絕的物種法案保護(hù)從lynx中除名。
如果退市,將制定一項(xiàng)監(jiān)測(cè)計(jì)劃,有關(guān)緬因州人口狀況及其與鄰近人口的連通性的信息對(duì)制定保護(hù)戰(zhàn)略極為重要。即使在恢復(fù)過(guò)程中,喇嘛也表示lynx將需要監(jiān)測(cè)和保護(hù)行動(dòng)來(lái)追蹤氣候變化和棲息地喪失。
她的聯(lián)合顧問(wèn),馬薩諸塞州合作魚(yú)類(lèi)和野生動(dòng)物研究部門(mén)負(fù)責(zé)人Stephen DeStefano和USGS合作魚(yú)類(lèi)和野生動(dòng)物研究部門(mén)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人John Organ表示,緬因州,新不倫瑞克省和魁北克省的人口之間存在連通性。勞倫斯是生存能力的關(guān)鍵,基因組工具可以幫助確保制定適當(dāng)?shù)谋Wo(hù)措施。
器官指出,“河流南部的這些人群之間的連通性可能對(duì)其持久性至關(guān)重要,如果有必要,土地保護(hù)策略將被設(shè)計(jì)用于促進(jìn)整個(gè)景觀(guān)的移動(dòng)和基因流動(dòng)。”
為此,喇嘛協(xié)調(diào)一個(gè)包括DeStefano和Organ的團(tuán)隊(duì),以及華盛頓特區(qū)史密森學(xué)會(huì)的保護(hù)遺傳學(xué)家Warren Johnson,緬因州內(nèi)陸漁業(yè)和野生動(dòng)物部的Jennifer Vashon及其同事,以及洛克菲勒大學(xué)VGL的生物信息學(xué)專(zhuān)家。
喇嘛對(duì)她說(shuō),本周的公共基因組揭曉不是結(jié)束,而是多年分析的開(kāi)始。作為保護(hù)遺傳學(xué)家,史密森學(xué)會(huì)的她和約翰遜將分析數(shù)據(jù),制作報(bào)告并解釋對(duì)于保護(hù)團(tuán)隊(duì)在明尼蘇達(dá)州,蒙大拿州/東北愛(ài)達(dá)荷州,華盛頓州,大黃石地區(qū)和科羅拉多州。
約翰遜說(shuō),像lynx這樣的可見(jiàn)和標(biāo)志性物種“為探索物種和自然環(huán)境之間復(fù)雜的生物,生態(tài)相互作用提供了一個(gè)很好的機(jī)會(huì),并且是使用基因組方法為我們的決策提供信息的一個(gè)很好的模型。”
DeStefano補(bǔ)充說(shuō):“任何時(shí)候我們都可以獲得更多有關(guān)其人口健康狀況的信息,我們會(huì)接受它。許多自然保護(hù)主義者對(duì)這只美麗的貓的未來(lái)非常感興趣,”他指出。
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