遺傳篩查發(fā)現(xiàn)兒童黑色素瘤的風險基因
根據(jù) St. Jude兒童研究醫(yī)院的研究者們在最近的《Nature Medicine》雜志上發(fā)表的文章,對青少年患者進行全面的臨床基因組檢測,包括全基因組測序,能夠幫助研究人員識別驅(qū)動最常見的兒童黑色素瘤的單個基因突變。
進一步的研究發(fā)現(xiàn),在這項研究中篩查出的spitzoid黑色素瘤的年輕人中有33%在同一基因MAP3K8中攜帶了新的突變,包括重排。在測試的近500名成人黑素瘤患者中,1.5%也發(fā)現(xiàn)了類似的突變。 (Spitzoid黑色素瘤發(fā)生在兒童和成人,但它是最常見的兒科黑色素瘤)
研究人員還報告了MAP3K8突變患者可能成為精準藥物候選者的證據(jù)。本研究中的初始患者對精確藥物的短期反應,該藥物針對由突變的MAP3K8解除調(diào)節(jié)的基因。
“這項研究表明,全基因組和全轉(zhuǎn)錄組測序可以揭示使用基因組的流行商業(yè)篩選測試所遺漏的驅(qū)動突變,”作者說道: “這些新發(fā)現(xiàn)的改變,包括基因融合,有可能影響治療。”
今年美國將診斷出大約96,480例黑色素瘤,其中1%至2%發(fā)生在兒童和青少年中。 Spitzoid黑色素瘤的范圍很廣,從緩慢生長的痣到侵襲性腫瘤。然而,在大約50%的病例中,驅(qū)動腫瘤的突變是未知的。這些結(jié)果表明MAP3K8是兒科spitzoid黑色素瘤中最常見的突變基因。
來自初始患者的遺傳物質(zhì)的測序和分析揭示了遺傳物質(zhì)的改變,包括基因CDKN2A / B的缺失和基因TERT中的突變,已知其為spitzoid黑素瘤提供燃料。但這個故事并不完整。
“激酶基因融合通常作為spitzoid黑色素瘤的起始驅(qū)動因素,腫瘤沒有攜帶以前與黑素瘤相關(guān)的激酶突變。”作者說道:“擁有全基因組和全轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)至關(guān)重要,它幫助我們識別基因重排并確定新的融合基因被翻譯成功能性蛋白質(zhì)。”
已知MAP3K8調(diào)節(jié)MEK,MEK是促進細胞分裂并在其他癌癥中失調(diào)的基因。科學文獻檢索發(fā)現(xiàn)了先前發(fā)表的研究,該研究表明MAP3K8可能在黑素瘤中發(fā)揮作用。
該研究結(jié)果推進了患者用trametinib進行治療,trametinib是一種抑制MEK蛋白的精確藥物。在對MEK抑制劑的初始陽性反應后,當它明顯停止工作并且患者出現(xiàn)副作用時停止治療。
當另一個新的MAP3K8突變在第二個患有spitzoid黑色素瘤的St. Jude患者中被發(fā)現(xiàn)時,研究人員將他們的分析擴展到包括來自49名患者的spitzoid腫瘤。篩查發(fā)現(xiàn)33%的患者攜帶MAP3K8突變。研究小組預測,他們發(fā)現(xiàn)的不同MAP3K8突變都會導致MAP3K8過度活躍并繼續(xù)激活MEK。
研究人員指出,研究結(jié)果強調(diào)了對trametinib和其他精確藥物進行臨床試驗的必要性,這些藥物針對本研究中發(fā)現(xiàn)的改變。 有證據(jù)表明患者對藥物產(chǎn)生了耐藥性。
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