超越基因 蛋白質(zhì)圖譜評分氮固定二重奏
在農(nóng)業(yè)生物技術(shù)的許多難以捉摸的grails中,賦予非豆科植物如谷物的固氮能力排在最頂端。這樣做是一個巨大的挑戰(zhàn),因為豆科植物與共生華爾茲中的細(xì)菌稱為根瘤菌,使植物能夠從空氣中提取營養(yǎng),并超越對環(huán)境有害的化學(xué)肥料的需求。自然過程是作物輪作實踐的核心,廣泛用于防止玉米等作物的土壤枯竭,這取決于合成肥料的使用。
事實上,兩種截然不同且非常相關(guān)的生物 - 植物和細(xì)菌 - 可以合作完成從大氣中吸取維持生命的氮的壯舉,這只是工廠工程師在尋求將這種質(zhì)量賦予其他方面時所面臨的挑戰(zhàn)之一。重要的作物。
然而,隨著植物和細(xì)菌蛋白質(zhì)的大量地圖集的發(fā)布,植物和細(xì)菌之間的共生過程發(fā)揮作用,這一挑戰(zhàn)的答案可能是一個更近的一步。
威斯康星大學(xué)麥迪遜分校的一個小組在當(dāng)前的自然生物技術(shù)中寫作,詳細(xì)介紹了超過23,000種植物和細(xì)菌蛋白質(zhì)以及它們實現(xiàn)有益關(guān)系的分子控制。該圖集,可能是迄今為止最詳盡的蛋白質(zhì)組學(xué)清單,詳細(xì)顯示了蛋白質(zhì)的相互作用,因為根瘤菌在模型豆科植物Medicago truncatula上定殖根瘤。
“我們可以比以往任何時候都更深入地了解蛋白質(zhì)組,”威斯康星大學(xué)麥迪遜生物分子化學(xué)和化學(xué)教授,以及新圖冊的相應(yīng)作者Joshua Coon解釋道。“我們能夠利用技術(shù)提供前所未有的蛋白質(zhì)觀察。”
他說,這張新照片將我們對固氮機制的理解提升到前所未有的細(xì)節(jié)水平。由于蛋白質(zhì)受基因調(diào)控,新的地圖集最終可能有助于為將豆科植物的固氮能力設(shè)計成其他植物的策略提供信息。
“將蛋白質(zhì)信息與遺傳網(wǎng)絡(luò)聯(lián)系起來非常重要,”威斯康星大學(xué)麥迪遜分校細(xì)菌學(xué)教授Jean-Michel Ane指出,他也是新報告的通訊作者。“它允許我們通過將基因表達(dá)與蛋白質(zhì)相關(guān)聯(lián)來看模式。”
Coon是該技術(shù)的領(lǐng)先權(quán)威,它允許科學(xué)家將樣品解析為其許多組成部分,并以精致的細(xì)節(jié)進行測量,因此新的地圖集是使用強大的新質(zhì)譜技術(shù)編制的。“測量樣品中蛋白質(zhì)數(shù)量的復(fù)雜性令人難以置信,”庫恩說。“了解這些基因是不夠的。有數(shù)百萬種方法可以修飾蛋白質(zhì),使它們具有新的使命。所有這些蛋白質(zhì)水平的信息都是新穎的,我們可以全面了解所有這些分子及其如何被修改并對功能做出一些預(yù)測。“
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