足夠的干細(xì)胞因子Nanog知道何時(shí)減速
轉(zhuǎn)錄因子Nanog在胚胎干細(xì)胞的自我更新中起著至關(guān)重要的作用。以前不清楚它的蛋白質(zhì)豐度是如何在細(xì)胞中調(diào)節(jié)的。HelmholtzZentrumMünchen和慕尼黑技術(shù)大學(xué)的研究人員與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的同事合作,現(xiàn)在在Cell Systems上報(bào)告說,現(xiàn)有的Nanog越多,其復(fù)制就越少。
每個(gè)干細(xì)胞研究人員都知道蛋白質(zhì)Nanog,因?yàn)樗梢源_保這些全能者繼續(xù)更新。一場(chǎng)有爭(zhēng)議的爭(zhēng)論圍繞著如何調(diào)節(jié)細(xì)胞中Nanog蛋白的數(shù)量。“到目前為止,人們常常認(rèn)為Nanog會(huì)激活自身,以保持胚胎干細(xì)胞的多能性,”Carsten Marr博士解釋說。他領(lǐng)導(dǎo)著亥姆霍茲中心慕尼黑計(jì)算生物學(xué)研究所(ICB)的定量單細(xì)胞動(dòng)力學(xué)研究小組。與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的同事一起,他和他的團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種名為STILT(譜系樹上的隨機(jī)推斷)的算法,現(xiàn)在反駁了這一假設(shè)。
利用STILT,科學(xué)家們從單個(gè)細(xì)胞中評(píng)估了時(shí)間分辨蛋白表達(dá)數(shù)據(jù)(已于2015年收集),其中Nanog可通過與熒光蛋白融合檢測(cè)到。“我們將以這種方式測(cè)量的Nanog動(dòng)力學(xué)與三種不同的模型進(jìn)行了比較。其中一個(gè)挑戰(zhàn)是模型的定量比較,另一個(gè)是在算法中考慮干細(xì)胞分裂,”第一作者賈斯汀博士報(bào)道。 Feigelman,作為博士后從亥姆霍茲中心慕尼黑搬到蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院。“結(jié)果顯示,Nanog受所謂的負(fù)反饋環(huán)調(diào)節(jié),這意味著細(xì)胞中存在的Nanog越多,其繁殖就越少。”
從計(jì)算機(jī)傳送到培養(yǎng)皿
為了檢查這些結(jié)果,科學(xué)家計(jì)算了如果Nanog 蛋白水平人為增加會(huì)發(fā)生什么。“我們實(shí)際上成功證實(shí)了STILT提出的另一項(xiàng)增加Nanog的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的假設(shè),”研究負(fù)責(zé)人Marr解釋道。
由于他們的研究,科學(xué)家們承諾更好地了解干細(xì)胞更新,并希望這些知識(shí)可能對(duì)未來的醫(yī)學(xué)應(yīng)用有用。“我們還將在未來將STILT應(yīng)用于其他時(shí)間分辨的單細(xì)胞數(shù)據(jù),這將使我們深入了解潛在的分子基因調(diào)控機(jī)制,”Marr解釋說。
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