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      改進的基因表達圖譜顯示許多人長的非編碼RNA實際上可能是功能性的
      
			
      
				2019-01-03 09:47:50
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      雖然曾經(jīng)有人認為基因調(diào)控生物功能幾乎完全是通過轉(zhuǎn)錄成編碼RNA然后翻譯成蛋白質(zhì)，但現(xiàn)在已知圖像更加復雜。事實上，研究基因與疾病之間關系的研究表明，大多數(shù)疾病變異是在蛋白質(zhì)編碼基因之外發(fā)現(xiàn)的。
      

      改進的基因表達圖譜顯示許多人長的非編碼RNA實際上可能是功能性的
      

      RIKEN領導的FANTOM聯(lián)盟在十多年前開創(chuàng)了非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)，首次揭示了哺乳動物基因組轉(zhuǎn)錄環(huán)境的復雜性。FANTOM聯(lián)盟繼續(xù)處于非編碼RNA起源和功能研究的前沿。在他們的最新作品中，發(fā)表于“ 自然”該團隊已經(jīng)生成了一個全面的人類長鏈非編碼RNA圖譜，其基因模型得到了顯著改善，使他們能夠更好地評估這些RNA的多樣性和功能性。今天繪制RNA轉(zhuǎn)錄圖譜的大多數(shù)嘗試依賴于測序技術，這些技術并不總是準確地鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的起點或5'末端。為了克服這一局限，該團隊使用了一種名為基因表達分析(CAGE)的技術，該技術是在RIKEN開發(fā)的，用于構建具有精確5'末端的人類長非編碼RNA圖譜，精確定位基因組中的位置。他們的轉(zhuǎn)錄被啟動了
      

      該圖譜包含27,919個長非編碼RNA，首次總結了它們在主要人類細胞類型和組織中的表達模式。通過將該圖譜與基因組和遺傳數(shù)據(jù)相交，他們的結果表明這些RNA中的19,175個可能是功能性的，暗示可能存在與人類中大約20,000個蛋白質(zhì)編碼基因一樣多或甚至更多功能的非編碼RNA?；蚪M。
      

      “科學界對于從我們的基因組產(chǎn)生的數(shù)千個長非編碼RNA是否具有功能性或僅僅是嘈雜的轉(zhuǎn)錄機制的副產(chǎn)品存在爭議。” 西澳大利亞大學Harry Perkins醫(yī)學研究所的Alistair Forrest教授和RIKEN生命科學技術中心(CLST)的高級訪問科學家，該論文的相應作者之一，“通過整合改進的基因模型根據(jù)基因表達，進化保守和遺傳研究的數(shù)據(jù)，我們發(fā)現(xiàn)有令人信服的證據(jù)表明這些長的非編碼RNA中的大多數(shù)似乎具有功能性，其中近2,000種我們揭示了它們可能參與疾病和其他遺傳特征。“
      

      “有趣的是，”該論文的第一作者CLST的Chung-Chau Hon說，“大多數(shù)長的非編碼RNA似乎是由增強子元件產(chǎn)生的。它加深了我們對長非編碼RNA的大部分異質(zhì)起源的理解。 “。
      

      根據(jù)CLST的Piero Carninci的說法，“改進的基因模型和來自該地圖集的人類長非編碼RNA的廣泛功能提示可以作為Rosetta Stone，讓我們通過實驗研究它們的功能相關性，作為我們正在進行的工作的一部分。即將出版的FANTOM聯(lián)盟。我們預計這些結果可能會進一步推動我們對基因組非編碼部分功能的理解。“
      
			

			
        
      
			
      
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