序列分析 - BMC生物信息學(xué)中的舊/新部分
到目前為止，BMC Bioinformatics已經(jīng)有一個(gè)用于方法的序列分析部分和另一個(gè)用于應(yīng)用的序列分析部分。雖然在創(chuàng)建期刊時(shí)有兩個(gè)獨(dú)立部分的原始理由是有意義的，但實(shí)際上我們觀察到在這兩個(gè)部分中發(fā)表的論文之間存在相當(dāng)多的主題重疊。此外，從評估稿件的貢獻(xiàn)的角度來看，我們得出的結(jié)論是，方法和應(yīng)用之間的區(qū)別并非真正必要。因此，決定將這些部分合并為一個(gè)簡單稱為序列分析的新部分。
序列分析仍然是一個(gè)充滿活力的研究領(lǐng)域，由DNA序列生成的持續(xù)指數(shù)增長推動(dòng)。作為示例，我們可以引用一些當(dāng)前與DNA測序相關(guān)的大型項(xiàng)目和計(jì)劃。去年湯普森等人。報(bào)告了地球微生物組項(xiàng)目的第一批結(jié)果，該項(xiàng)目正在對各種生態(tài)位中的微生物組進(jìn)行測序。另一方面，人類微生物組計(jì)劃已經(jīng)持續(xù)了好幾年。Lewin等人。今年早些時(shí)候宣布了地球生物基因組計(jì)劃，旨在對10年內(nèi)地球上所有真核生物多樣性的基因組進(jìn)行測序，編目和表征。而在10月3日第三屆今年，英國衛(wèi)生和社會關(guān)懷部宣布計(jì)劃在未來五年內(nèi)在英國對500萬人類基因組進(jìn)行測序。這些項(xiàng)目和舉措突出了DNA測序在醫(yī)學(xué)和理解地球生物多樣性方面的持續(xù)相關(guān)性，僅舉兩個(gè)潛在的應(yīng)用領(lǐng)域。
鑒于隨之而來的數(shù)據(jù)泛濫，從這些數(shù)據(jù)中提取科學(xué)知識和實(shí)踐知識的需求比以往任何時(shí)候都要大。因此，對序列分析和新的相關(guān)程序和方法的進(jìn)一步研究變得更加重要。
新的序列分析部分的范圍反映了這種合并：我們尋找高質(zhì)量的手稿，提供新的算法或軟件/工作流程的主題，如序列比對，DNA片段組裝，基因預(yù)測，非編碼RNA檢測和分析，全基因組分析，系統(tǒng)發(fā)育和系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)，分類學(xué)分類和宏基因組數(shù)據(jù)的基因組恢復(fù)，以及許多其他可能的主題。
BMC生物信息學(xué)還有其他具有相關(guān)范圍的部分，特別是比較基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組分析，以及最近推出的生物信息學(xué)中的機(jī)器學(xué)習(xí)和人工智能。使用DNA / RNA序列或基因組作為主要數(shù)據(jù)的手稿的前瞻性作者可以將他們的工作提交給序列分析部分，或者他們認(rèn)為與他們的工作最相關(guān)的部分。
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