第一張蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位的綜合圖譜揭示了新的見解
關(guān)于蛋白質(zhì)如何在細(xì)胞中排列的第一次分析今天發(fā)表在“ 科學(xué)”雜志上,揭示了大部分人類蛋白質(zhì)可以在給定細(xì)胞中的多個(gè)位置發(fā)現(xiàn)。使用位于瑞典的Cell Atlas,研究人員檢查了與大多數(shù)蛋白質(zhì)編碼基因相對(duì)應(yīng)的人類蛋白質(zhì)組的空間分布,他們以前所未有的細(xì)節(jié)描述了蛋白質(zhì)在人體最小單位的各種細(xì)胞器和子結(jié)構(gòu)中的分布。 細(xì)胞。
在細(xì)胞內(nèi),細(xì)胞器產(chǎn)生分區(qū),形成封閉的環(huán)境,用于化學(xué)反應(yīng),以滿足細(xì)胞中的特定功能。由于這些功能與特定的蛋白質(zhì)組緊密相關(guān),因此了解人類蛋白質(zhì)組的亞細(xì)胞定位是了解人類細(xì)胞功能和潛在機(jī)制的關(guān)鍵知識(shí)。
該研究由KTH皇家理工學(xué)院副教授Emma Lundberg領(lǐng)導(dǎo),負(fù)責(zé)瑞典斯德哥爾摩科學(xué)生命實(shí)驗(yàn)室(SciLifeLab)的高內(nèi)容顯微鏡設(shè)施。該團(tuán)隊(duì)生成了超過300,000張圖像,系統(tǒng)地解析了培養(yǎng)細(xì)胞系中人類蛋白質(zhì)的空間分布,并將它們映射到具有單細(xì)胞分辨率的細(xì)胞區(qū)室和子結(jié)構(gòu)。
Cell Atlas是人類蛋白質(zhì)圖譜計(jì)劃超過10年的研究成果,于2016年12月推出。“ 科學(xué)”雜志的文章描述了作為國際努力的一部分創(chuàng)建的數(shù)十萬張圖像的詳細(xì)分析,還涉及中國,韓國,印度,丹麥和德國的團(tuán)體。
“只有通過研究人體最小功能單元的分子成分 - 細(xì)胞 - 我們才能全面了解人類生物學(xué),”KTH教授Mathias Uhlen教授說道,他是人類蛋白質(zhì)圖譜的主任。“Cell Atlas為研究人員提供新知識(shí),促進(jìn)個(gè)體蛋白質(zhì)的功能探索及其在人類生物學(xué)和疾病中的作用。”
發(fā)表的文章還包括由英國劍橋大學(xué)劍橋蛋白質(zhì)組學(xué)中心主任Kathryn Lilley進(jìn)行的比較研究,該研究使基于抗體的免疫熒光(IF)顯微鏡分析能夠通過使用質(zhì)量的替代映射策略進(jìn)行驗(yàn)證。法。
將13,993種抗體靶向的總共12,003種蛋白質(zhì)分為30個(gè)細(xì)胞區(qū)室和子結(jié)構(gòu)中的一種或幾種,共同定義了13種主要細(xì)胞器的蛋白質(zhì)組。具有最大蛋白質(zhì)組的細(xì)胞器是細(xì)胞核(6,930)及其子結(jié)構(gòu),例如體和斑點(diǎn),以及胞質(zhì)溶膠(4,279)。
有趣的是,大約一半的蛋白質(zhì)存在于一個(gè)以上的區(qū)室中,在細(xì)胞的功能不相關(guān)部分顯示共享的蛋白質(zhì)庫。這一發(fā)現(xiàn)揭示了細(xì)胞的復(fù)雜性。
Cell Atlas是一種開放獲取資源,可供世界各地的研究人員用于研究感興趣的蛋白質(zhì)或細(xì)胞器。倫德伯格說。“Atlas支持系統(tǒng)生物學(xué)和細(xì)胞建模應(yīng)用,它也是圖像模式識(shí)別中機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用的高價(jià)值資源。”
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