報(bào)告了人類(lèi)基因組功能部分的新限制
休斯敦大學(xué)的一位進(jìn)化生物學(xué)家發(fā)表了新的計(jì)算結(jié)果,表明不超過(guò)25%的人類(lèi)基因組功能正常。這與ENCODE項(xiàng)目的科學(xué)家提出的建議形成鮮明對(duì)比,即多達(dá)80%的基因組具有功能性。在Genome Biology and Evolution在線(xiàn)發(fā)表的工作中,Dan Graur報(bào)告人類(lèi)基因組的功能部分可能介于10%和15%之間,上限為25%。其余的是所謂的垃圾DNA,或無(wú)用但無(wú)害的DNA。Graur,John和Rebecca Moores UH的生物學(xué)和生物化學(xué)教授采用了一種看似簡(jiǎn)單的方法來(lái)確定有多少基因組功能,使用有害突變率 - 即有害突變發(fā)生的速率- 以及替代生育率率。
這兩個(gè)基因組大小與先前已確定的有害突變的基因組中的功能部件的速度,和歷史數(shù)據(jù)文件的人口水平。有了這些信息,Graur開(kāi)發(fā)了一個(gè)模型,用于計(jì)算由有害突變引起的繁殖成功率下降,稱(chēng)為“突變負(fù)荷”,與基因組功能部分相關(guān)。
基因組的功能部分被描述為具有選擇效應(yīng)功能的功能部分,即,通過(guò)自然選擇產(chǎn)生并保持的功能。蛋白質(zhì)編碼基因,RNA指定基因和DNA受體是選擇效應(yīng)功能的實(shí)例。在他的模型中,只有基因組的功能部分可能被有害突變破壞; 非功能部分的突變是中性的,因?yàn)闊o(wú)功能部分既不會(huì)損壞也不會(huì)改善。
由于有害突變,每一代中的每對(duì)夫婦必須產(chǎn)生比兩個(gè)更多的孩子,以維持不變的種群規(guī)模。他說(shuō),在過(guò)去20萬(wàn)年中,替代水平的生育率從每對(duì)夫婦2.1到3.0個(gè)孩子不等,并指出全球人口在19世紀(jì)初期間保持非常穩(wěn)定,當(dāng)時(shí)新生兒死亡率下降導(dǎo)致生育率超過(guò)替代水平。
Graur發(fā)現(xiàn),如果80%的基因組功能正常,即使有害突變率處于估計(jì)的低端,也需要不切實(shí)際的高出生率來(lái)維持人口。
他寫(xiě)道:“人類(lèi)80%的基因組功能正常,世界上每對(duì)夫婦平均只能生15個(gè)孩子,除了兩個(gè)孩子外,其他所有孩子都必須死亡或不能繁殖。” “如果我們使用有害突變率的上限(每代每個(gè)核苷酸2×10?8個(gè)突變),那么......每對(duì)夫婦必須保持不變的種群數(shù)量的孩子數(shù)量將超過(guò)這個(gè)數(shù)量可見(jiàn)宇宙中的恒星數(shù)量級(jí)為10個(gè)數(shù)量級(jí)。“
2012年,DNA元素百科全書(shū)(ENCODE)宣布80%的基因組具有生化功能。格勞爾說(shuō),這項(xiàng)新研究不僅使這些說(shuō)法得以休息,而且有望有助于重新聚焦人類(lèi)基因組學(xué)的科學(xué)。
“我們需要了解人類(lèi)基因組的功能部分,以便將生物醫(yī)學(xué)研究的重點(diǎn)放在可用于預(yù)防和治愈疾病的部位,”他說(shuō)。“沒(méi)有必要對(duì)太陽(yáng)下的所有事物進(jìn)行排序。我們只需要對(duì)我們知道的部分進(jìn)行排序。”
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