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      暫停閱讀交通標(biāo)志 細(xì)菌中DNA轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)

      細(xì)胞的存活與其他重要方面不同 - 時(shí)間問題:歌德大學(xué)的科學(xué)家和其他大學(xué)的同事現(xiàn)在已經(jīng)確定了這種機(jī)制的不同部分,并介紹了該過程的模型。生物學(xué)的核心原則之一是信息從DNA流向RNA,以編碼在細(xì)胞中起作用的蛋白質(zhì)。可以說,與遺傳密碼一樣重要的是這種信息流的時(shí)機(jī)。通過在合適的時(shí)間產(chǎn)生正確的RNA和正確的蛋白質(zhì),細(xì)胞可以有效地制定其生存和成功的策略。一種這樣的調(diào)節(jié)元件,即核糖開關(guān),作為抗生素的潛在靶標(biāo)引起了人們的興趣。經(jīng)過10多年的研究,Harald Schwalbe教授在歌德大學(xué)的研究小組與威斯康星大學(xué)的Landick小組,歌德大學(xué)生物系的JensWöhnert教授和達(dá)姆施塔特工業(yè)大學(xué)的Süß小組合作,

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      核糖開關(guān)是一小段RNA,可以折疊成不同的結(jié)構(gòu),這取決于一個(gè)小的信使分子是否與它結(jié)合。在轉(zhuǎn)錄核糖開關(guān)中,這些不同的結(jié)構(gòu)表明附近的RNA聚合酶繼續(xù)產(chǎn)生RNA或停止。在他們最近在ELife上發(fā)表的文章中,Schwalbe小組及其合作者在合成后釋放了xpt-pbuX核糖開關(guān)的分子結(jié)構(gòu),并在小信使分子鳥嘌呤結(jié)合后的位置上釋放。他們還證明了這種切換到接通位置需要一定的時(shí)間。這對該監(jiān)管程序提出了一定的要求。

      由于RNA聚合酶沿著DNA鏈飛行,產(chǎn)生相應(yīng)的RNA,它到達(dá)xpt-pbuX開關(guān)的代碼,制造核糖開關(guān),并繼續(xù)。如果不在鳥嘌呤附近,RNA聚合酶將檢測默認(rèn)的關(guān)閉位置并停止合成。然而,如果鳥嘌呤與核糖開關(guān)結(jié)合,則核糖開關(guān)需要重新折疊到位置,RNA聚合酶必須等待足夠長的時(shí)間才能檢測到新的構(gòu)象。否則,它將始終讀為“關(guān)閉”,并且永遠(yuǎn)不會(huì)讀取該基因。Schwalbe和他的同事發(fā)現(xiàn),這種暫停確實(shí)存在,并且它被編碼到DNA中。產(chǎn)生xpt-pbuX開關(guān)后,RNA 聚合酶 在DNA代碼上遇到這個(gè)“暫停站點(diǎn)”并減慢速度,讓核糖開關(guān)重新折疊適當(dāng)?shù)臅r(shí)間。

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