研究人員改進(jìn)了使用環(huán)境DNA鑒定水生物種的方法
確定哪些魚生活在各種水體中對(duì)于研究這些種群的科學(xué)家來說是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。例如,識(shí)別入侵或?yàn)l危物種通常依賴于捕獲它們的能力?,F(xiàn)在,根據(jù)發(fā)表在“ 生態(tài)學(xué)與進(jìn)化方法”中的一項(xiàng)新研究,研究人員通過使用這些生物留下的生物材料(稱為環(huán)境DNA(eDNA))改進(jìn)了他們追蹤物種的方法,eDNA的痕跡攜帶與直接DNA樣品相同的重要信息,例如血液或組織樣品。想想法醫(yī)科學(xué)家所做的工作,他們可以識(shí)別一縷頭發(fā)中的個(gè)體。
到目前為止,研究人員認(rèn)為生物體在水環(huán)境中脫落的DNA顯著降解,質(zhì)量較差,因此很難將這些碎片與特定物種相匹配。
事實(shí)證明,魚類流入水中的細(xì)胞保護(hù)了緊密盤繞的DNA。“我們成功地檢測(cè)并處理了長(zhǎng)而完整的DNA片段,”基因組學(xué)和生物信息學(xué)核心設(shè)施主任,生物科學(xué)系和諾瑞大學(xué)環(huán)境變化倡議副教授Michael E. Pfrender說。圣母院。“這完全改變了我們只能使用高度降解的eDNA的短片段的普遍看法。現(xiàn)在,我們可以開始使用從這些長(zhǎng)鏈DNA中提取的信息來開發(fā)更準(zhǔn)確的物種鑒定并檢測(cè)物種內(nèi)的遺傳變異。”
研究人員從區(qū)域湖泊,池塘和溪流中采集水樣,并使用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)從這些環(huán)境中發(fā)現(xiàn)的eDNA擴(kuò)增或復(fù)制整個(gè)線粒體基因組。
通過這種改進(jìn)的方法,科學(xué)家可以更詳細(xì)地了解各種水生棲息地的生物多樣性。“正在不斷努力填充數(shù)據(jù)庫,如國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)Genbank,”Pfrender說。“我們沒有對(duì)我們想監(jiān)測(cè)的所有生物多樣性進(jìn)行遺傳簽名。這些數(shù)據(jù)庫對(duì)于幫助我們識(shí)別生活在這些社區(qū)內(nèi)的各種物種至關(guān)重要。”
研究中使用的方法不僅更準(zhǔn)確,而且在尋找和管理入侵物種方面更有效。
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