中文字幕在线天|亚洲一区二区三区手机版|少妇中文字幕乱码亚洲影视|最好看的久久综合伊人



      

      
  

      

      
	
	

      

      



      

	
      

      
	
      
  	       
      
       中國基因網(wǎng)您的位置：首頁 >行業(yè)資訊 >        
      
  
      
		
      
			
      研究人員推翻了有關(guān)下一代DNA技術(shù)功效的智慧
      
			
      
				2018-12-25 08:36:06
				?
			  來源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      宏基因組學(xué)使我們能夠以比以往更大的規(guī)模研究微生物生態(tài)學(xué)，并揭示以前看不見的微觀生命多樣性。科學(xué)報告中出現(xiàn)的一項新研究表明，衡量微生物生物多樣性的一種有利方法并不像以前認為的那樣準(zhǔn)確。題為“ 16S擴增子和霰彈槍測序之間微生物多樣性發(fā)現(xiàn)的大規(guī)模差異”的文章是一個國際研究團隊的合作，包括紐約城市大學(xué)(CUNY)City Tech的Mercer R. Brugler博士。
      

      研究人員推翻了有關(guān)下一代DNA技術(shù)功效的智慧
      

      現(xiàn)代宏基因組環(huán)境DNA研究幾乎完全依賴于新一代測序(NGS)，使得方法評估至關(guān)重要。研究人員在巴西四個主要河流漫灘系統(tǒng)(亞馬遜，阿拉瓜亞，巴拉那和潘塔納爾)的水樣中比較了兩種NGS技術(shù) - 擴增子和霰彈槍。通過擴增子測序鑒定的門的不到50%是從鳥槍測序中恢復(fù)的，從根本上挑戰(zhàn)了霰彈槍恢復(fù)比基于擴增子的方法更多樣化的教條。擴增子測序也顯示出大約27%的家庭?？傮w而言，擴增子數(shù)據(jù)在不同分類學(xué)規(guī)模的生物多樣性和群落生態(tài)學(xué)分析中更為穩(wěn)健。
      

      這項工作使類似研究的樣本量增加了一倍，并且新穎地整合了每個站點的環(huán)境數(shù)據(jù)(例如，pH，溫度，營養(yǎng)素)，根據(jù)使用的數(shù)據(jù)顯示出不同的相關(guān)性。雖然可以獲得有關(guān)NGS技術(shù)和生物信息管道的無數(shù)變體，但結(jié)果表明迄今為止在任何研究中都沒有突出的核心差異。鑒于將獵槍數(shù)據(jù)與基于進化枝的分類算法相結(jié)合時確定的分類群數(shù)量較少，以前使用此類生物信息學(xué)工具量化生物多樣性的研究應(yīng)謹慎觀察或重新分析。盡管如此，霰彈槍具有互補的優(yōu)勢，在設(shè)計項目時應(yīng)該權(quán)衡。
      

      這項研究的結(jié)果將對先前使用霰彈槍數(shù)據(jù)的微生物生物多樣性分析以及微生物DNA如何從這一點進行測序和/或分析產(chǎn)生影響。
      
			

			
        
      
			
      
            鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。
			
      
			
			
      
        
      推薦內(nèi)容