晶體結(jié)構(gòu)揭示了非標(biāo)準(zhǔn)RNA轉(zhuǎn)錄的細(xì)節(jié)
高分辨率晶體結(jié)構(gòu)揭示了在非傳統(tǒng)轉(zhuǎn)錄形式期間RNA的新途徑 - 從DNA模板產(chǎn)生RNA的過(guò)程。在重復(fù)轉(zhuǎn)錄過(guò)程中捕獲,這是一種轉(zhuǎn)錄形式,其中單個(gè)DNA堿基(由字母A,T,C和G表示)編碼RNA中的幾個(gè)相應(yīng)堿基(DNA中的一個(gè)G導(dǎo)致幾個(gè)Gs)例如,在RNA中,新的晶體結(jié)構(gòu)揭示了通過(guò)替代通道離開(kāi)聚合酶的RNA,以實(shí)現(xiàn)這種非傳統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄模式。描述賓夕法尼亞州立大學(xué)和阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校研究小組發(fā)現(xiàn)的論文發(fā)表在“美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊”上。
“在X射線晶體學(xué)的經(jīng)典觀點(diǎn)中,你會(huì)認(rèn)為酶-RNA 聚合酶將被滅活,我們無(wú)法在結(jié)晶狀態(tài)下捕獲生化過(guò)程,”生物化學(xué)教授Katsuhiko S. Murakami說(shuō)。和賓夕法尼亞州的分子生物學(xué)和該論文的作者。“但在包括我們?cè)趦?nèi)的一些系統(tǒng)中,RNA聚合酶仍然存活,因此我們可以在制造RNA的過(guò)程中監(jiān)測(cè)結(jié)構(gòu)。”
賓夕法尼亞州立大學(xué)和諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)得主保羅·伯格在20世紀(jì)60年代早期在斯坦福大學(xué)的名譽(yù)主席羅伯特W.和Vivian K.卡希爾退休教授中發(fā)現(xiàn)了重復(fù)轉(zhuǎn)錄。盡管將DNA序列準(zhǔn)確地轉(zhuǎn)錄成RNA可能看起來(lái)是一個(gè)簡(jiǎn)單的錯(cuò)誤 - 當(dāng)RNA鏈相對(duì)于聚合酶內(nèi)的DNA鏈滑動(dòng)時(shí),發(fā)生重復(fù)轉(zhuǎn)錄 - 它在細(xì)胞中起作用。重復(fù)轉(zhuǎn)錄在控制許多基因的基因表達(dá)中起著關(guān)鍵作用,但盡管有這一重要作用,其機(jī)制仍然是一個(gè)黑盒子。
“我們的工作擴(kuò)展了我們對(duì)RNA轉(zhuǎn)錄所涉及的分子機(jī)制的靈活性的理解,”賓夕法尼亞州立大學(xué)研究助理兼該論文作者Vadim Molodtsov說(shuō)。“通過(guò)在重復(fù)轉(zhuǎn)錄過(guò)程中捕獲RNA聚合酶的晶體結(jié)構(gòu),我們能夠確定RNA用于退出酶的新途徑。它不是通過(guò)門(mén)進(jìn)入,而是偷偷溜出窗外。”
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