便攜式DNA測序儀幫助非洲農(nóng)民對抗作物病害
西澳大利亞大學的科學家們正在東非首次使用新的便攜式DNA測序技術,以幫助農(nóng)民對抗作物病害的破壞性影響。使用便攜式實時DNA分析設備,與病害木薯 作物作斗爭的農(nóng)民可以根據(jù)有關植物健康的信息立即采取措施挽救他們的生計。DNA手持式測序儀,名為MinION,由英國公司Oxford Nanopore開發(fā)。它被用來確定哪種病毒株正在摧毀坦桑尼亞和烏干達農(nóng)民的木薯作物,這是科學家和農(nóng)民合作的一部分,稱為木薯病毒行動計劃(CVAP)。
西澳大學高級研究員Laura Boykin博士是該項目的主要研究人員之一,坦桑尼亞Mikocheni農(nóng)業(yè)研究??所所長Joseph Ndunguru和烏干達國家農(nóng)業(yè)研究組織研究項目負責人Titus Alicai。Boykin博士說,因為MinION能夠實時提供信息,與通常的三個月相比,農(nóng)民能夠更快地采取行動。
全球有8億人依賴受威脅的木薯作物,該團隊現(xiàn)在計劃擴大該項目,旨在降低社區(qū)作物歉收的風險并幫助維持生計。
木薯是木薯來源的碳水化合物作物,在發(fā)展中國家的農(nóng)業(yè)中發(fā)揮著關鍵作用。它目前被幾種導致兩種疾病的病毒所摧毀; “木薯花葉病”(CMD)導致了20世紀20年代和90年代的大饑荒,以及“木薯褐條病”(CBSD),其流行病在東非迅速擴散。
由粉虱攜帶的這兩種疾病都阻止了木薯植物的正常生長。這導致農(nóng)民的收成顯著減少甚至完全損失。病毒使植物不能食用和不可銷售,必須銷毀作物以阻止其蔓延。
Ndunguru先生說:“我們已經(jīng)證明口袋DNA測序儀可以使那些通常無法獲得這些技術的農(nóng)村社區(qū)受益,因為它們通常更昂貴,更慢。”“即使在這個試點項目中,通過快速準確地識別病毒,農(nóng)民現(xiàn)在可以了解哪些作物可以種植,這些作物對特定病毒種類/菌株具有抗性。這是獲得持久抗病性和提高作物生產(chǎn)力的關鍵。它也易于使用,無需大型基礎設施和人員配備。
Boykin博士說,該團隊計劃在坦桑尼亞和烏干達擴大該項目,并與尚未受到木薯粉虱病毒影響的其他國家合作,如泰國和巴西。“如果沒有找到更好的策略來應對這種作物病害,那么數(shù)百萬人可能會受到影響 - 我們需要考慮經(jīng)濟以及個別家庭,”她說。
MinION重量僅為100克,可用于任何可以插入筆記本電腦或PC的地方,用于對木薯植物和粉虱進行測序,從而確定存在的病毒的精確菌株以及品種農(nóng)民種植的木薯
木薯疾病診斷項目由比爾和梅林達蓋茨基金會和英國國際發(fā)展部共同資助
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