一體化修復工具包使CRISPR基因編輯更加精確
在過去的五年中,CRISPR-Cas9技術因其易于操作和低成本而徹底改變了基因編輯領域。但是,雖然這項技術能夠可靠地發(fā)現(xiàn)并切斷目標DNA序列的延伸,但根據(jù)需要修復該切割是一個不容置疑的過程。當目標是糾正導致遺傳疾病的DNA中的錯別字時,錯誤率高達50%是一個特殊問題?,F(xiàn)在,由威斯康星大學麥迪遜分校生物醫(yī)學工程教授Krishanu Saha領導的一個研究小組已經(jīng)使修復不那么容易出錯,并于今天(2017年11月23日)在Nature Communications雜志上發(fā)布了它的方法。與標準CRISPR技術相比,新方法提高了將DNA序列完全按照所需要的10倍重寫的可能性。研究人員通過利用稱為RNA適體的分子膠來組裝和交付,從而實現(xiàn)了更高的精確度。一個完整的CRISPR修復工具包到DNA切割的位點。“該試劑盒不僅提供了分子剪,還提供了正確的細胞機器模板,用于修復DNA切割,”Saha說。“由于RNA適體結實且非常穩(wěn)定,我們所需要的一切就是一舉到達細胞內的正確位置。”
在標準CRISPR技術中,細菌來源的Cas9蛋白(剪刀)和指導RNA分子(定位靶DNA序列)被遞送至細胞。當剪刀切開DNA分子后,細胞會修補附近DNA模板的間隙,但是用分子膠將所需模板附加到Cas9 / RNA包裝上會產生更忠實的重寫。
與現(xiàn)有技術相比,新方法具有其他幾個優(yōu)點。首先,現(xiàn)成的試劑盒僅包含非病毒試劑,這簡化了制造過程并減少了未來遺傳手術臨床應用的安全性問題。其次,將RNA適體連接到試劑盒比修改Cas9蛋白更容易,并提供更大的靈活性。“我們可以在這個工具包中添加其他生物分子,就像你將一個額外的LEGO塊單擊到已有的結構中一樣,”Saha實驗室的研究生和該論文的第一作者Jared Carlson-Stevermer說。
這種樂高積木的一個例子是熒光標簽,使研究人員能夠輕松識別細胞群中所有精確編輯的DNA序列。“通過捕獲這些標簽,我們可以實現(xiàn)98%的準確率,”Saha說。
其他類型的樂高積木可以幫助激活正確類型組織中的修復工具包:治療視網(wǎng)膜疾病的眼睛,或肌營養(yǎng)不良患者的肌肉細胞。在目前的研究中,研究人員糾正了源自Pompe病患者的干細胞系中的特定突變,其保真度大大提高。Pompe病是一種罕見的遺傳性疾病,由器官和肌肉組織中復雜糖分子的積累引起。“這種基因手術的候選人并不缺乏,因為數(shù)以萬計的疾病是由于這種技術可以修復的小序列錯誤造成的,”Saha說。“我們的下一個目標是在動物模型中測試該方法,并致力于編寫更長的DNA片段。”
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