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      海洋中發(fā)現(xiàn)的新型病毒
      
			
      
				2018-12-13 19:49:23
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      一種病毒主導水樣來自世界上的海洋一直逃分析因為它有特點,標準測試無法檢測。然而,麻省理工學院和阿爾伯特·愛因斯坦醫(yī)學院的研究人員已經(jīng)設法隔離并研究這些難以捉摸的病毒的代表,提供病毒進化的關鍵缺失的環(huán)節(jié),發(fā)揮著重要的作用在調節(jié)細菌種群,一項新的研究報道。
      

      海洋中發(fā)現(xiàn)的新型病毒
      

      病毒的主要捕食者是細菌,細菌病毒的研究結果表明,當前視圖的多樣性有一個很大的盲點。通過詳細分析這些結論出現(xiàn)了海洋樣品由麻省理工學院博士后凱瑟琳·考夫曼,土木與環(huán)境工程教授馬丁•Polz Libusha凱利的阿爾伯特·愛因斯坦醫(yī)學院的教授,9人。結果被報道在本周《自然》雜志上。
      

      新發(fā)現(xiàn)的病毒缺乏“尾巴”上發(fā)現(xiàn)大多數(shù)編目和測序的細菌病毒,和其他幾個不同尋常的特性,導致錯過了之前的研究。紀念這一事實,研究者命名這個新的集團Autolykiviridae-after字符來自希臘神話傳奇難以捕捉。,不像典型的捕食的病毒只是一個或兩種類型的細菌,這些無尾的品種可以感染幾十種不同的類型,往往不同的物種,強調生態(tài)相關性。
      

      這項研究“打開新途徑,促進我們對角色的理解病毒的海洋,”杰德Fuhrman說McCulloch-Crosby椅子南加州大學海洋生物學,他并沒有參與這項工作。”在實際意義上,它還表明,我們需要改變一些常用方法為了捕捉這些病毒的各種研究,”他說。“我認為這是一個重要的進步。”
      

      當前的環(huán)境模型病毒———交互是基于研究跟蹤病毒,考夫曼說,所以他們可能會丟失在本質上發(fā)生相互作用的重要方面。
      

      “我們已經(jīng)知道病毒是非常重要的,”考夫曼說,他指的是海洋表面,研究者的樣本了,大約有1000萬中發(fā)現(xiàn)的病毒是每毫升的水。Polz說,“大多數(shù)的病毒在實驗室學習反面,大多數(shù)的海洋不。”所以研究小組決定研究無尾的病毒的一個子集,這稱為弧菌感染的細菌。廣泛的測試后,他們發(fā)現(xiàn)“,這些感染異常大量的主機,”他說。
      

      測序Autolykiviridae代表后,研究人員發(fā)現(xiàn)”他們的基因組非常不同于其他病毒,“Polz說。首先,他們的基因組非常短:大約10000基地,而典型的40000 - 50000跟蹤病毒。“當我們發(fā)現(xiàn)的時候,我們很吃驚,”他說。
      

      新的序列信息,研究人員能夠梳理數(shù)據(jù)庫和發(fā)現(xiàn)這種病毒存在于很多地方。這項研究還顯示,這些病毒往往是弱勢的數(shù)據(jù)庫,因為通常在實驗室處理樣品的方法。團隊開發(fā)的方法從環(huán)境樣品可以幫助研究人員獲得這些病毒在未來避免這種損失的信息。此外,考夫曼說,一般情況下,研究者測試病毒活動是由感染細菌的病毒樣本,然后檢查樣品一天后尋找跡象表明補丁的細菌被殺死了。但這些特定nontailed病毒往往較為緩慢,行事和殺死了區(qū)域不出現(xiàn),直到幾天之后他們的存在從來沒有注意到大多數(shù)的研究。
      

      新群病毒可能尤其普遍。“我們不認為這是ocean-specific,“Polz說。例如,病毒在人類的生物群落,甚至可能普遍主要生物地球化學循環(huán)和他們可能起到一定的作用,他說,比如碳的循環(huán)。
      

      論文研究的另一個重要方面是,Autolykiviridae被證明是一個古老的病毒家族的成員定義為特定類型的衣殼,蛋白質外殼將病毒DNA。雖然這血統(tǒng)是非常不同的動物和protists-and包括腺病毒等病毒感染人類,和巨大的病毒感染algae-very很少發(fā)現(xiàn)這種病毒感染細菌。
      
			

			
        
      
			
      
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