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      人類基因組計劃后17年 X染色體的解碼填補了很多空白

      人類基因組計劃后17年,X染色體的解碼填補了很多空白。那么X染色體的解碼讓我們發(fā)現(xiàn)了什么東西呢?你是不是很好奇呢?讓我們跟隨去看看吧!

      2003年,人類基因組計劃結(jié)束了13年長跑,成功測序人體90%以上的基因,但其余部分仍難以解碼。

      近年來,DNA讀取技術(shù)不斷改善,這些空缺被逐步填滿,研究人員得以進一步繪制完整的人類基因組圖譜。但還是有百余個區(qū)域未得完成,其中就包括X染色體上的幾個部分。

      而近期發(fā)表于Nature的一項研究顯示,科學家首次確定從端粒到端粒的X染色體的完整序列,此成就能幫助科學家進一步了解多種遺傳條件。

      測序X染色體及其它染色體的區(qū)域難倒了科學家,因為這些部位包含大量重復的DNA片段,令測序變得棘手,片段上有著重復了成千上萬次的DNA字母(即堿基)。

      加利福尼亞大學加州圣克魯斯分校的DNA生物學家、該論文作者卡倫·米加表示:“直到最近,組裝或拼湊這些片段才成為可能。”

      研究人員采用高級測序技術(shù),專注于解碼X染色體,因為絕大多數(shù)人至少有一條X染色體。通常,從生理上的女性有一對X染色體,生理上是男性的人有一條X染色體和一條Y染色體。

      米加說:“基因遺傳學及基因組學領(lǐng)域研究X染色體,因其與許多遺傳特性及疾病相關(guān)聯(lián)。”比如,X染色體與色盲、杜氏肌營養(yǎng)不良及血友病有關(guān)。

      米加與來自美國國家人類基因組研究所的研究員亞當·菲利皮合作,采用長讀長測序,即能一次讀取長鏈DNA堿基的技術(shù)進行研究。人類基因密碼長到難以想象——約60億個堿基——且DNA測序儀無法同時讀取所有堿基。

      因此,研究人員不得不將基因組切割為含有上百個堿基的小片段,這樣便可以一次分析一個小片段。任務完成后,研究人員還須重新拼接這些片段。

      在人類基因組項目初期,科學家一次僅能讀取500個堿基。20世紀中期,測序技術(shù)愈加精準,但其速度降至每次讀取100至200個堿基。到2010年,新技術(shù)問世,可一次讀取約10000個堿基。使用舊測序技術(shù)時,這些重復DNA片段切割出的短片段十分相似,幾乎沒有能將它們拼接的線索。

      現(xiàn)在,測序技術(shù)的改進意味著一些儀器可以同時讀取約100000甚至更多的堿基。米加與菲利皮團隊采取兩種工具分析X染色體,染色體來自內(nèi)含兩個相同X染色體的特殊細胞。之后,菲利皮及其團隊使用新創(chuàng)建的電腦程序拼接這些片段。

      在X染色體上,他們能夠填補染色體中央及許多基因上的空白部分。這樣一來,盡管研究人員沒發(fā)現(xiàn)什么大驚喜——比如沒有新的、尚待發(fā)現(xiàn)的基因,但他們發(fā)現(xiàn)了許多在基因組重復片段中的變化。變化包括DNA堿基替換、缺失或插入,也包括較長DNA片段的復制、易位或倒置,這些問題會導致基因疾病。

      米加說:“你可以對人群中一些最豐富的序列多樣性視而不見,而你所忽視的或許就與此前無法研究的疾病有關(guān)。”

      進一步研究這些尚未測序的區(qū)域會開辟基因組新疆界,研究人員可以以此尋找基因突變與原因未知的基因疾病之間的聯(lián)系。接下來,研究人員把目光轉(zhuǎn)向下一個未完整測序的染色體,以期最終能拼接出首個完整的人類基因組序列。

      人類基因組計劃(英語:Human Genome Project, HGP)是一項規(guī)模宏大,跨國跨學科的科學探索工程。其宗旨在于測定組成人類染色體(指單倍體)中所包含的30億個堿基對組成的核苷酸序列,從而繪制人類基因組圖譜,并且辨識其載有的基因及其序列,達到破譯人類遺傳信息的最終目的。

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