新的篩選方法揭示了microRNA在乳頭瘤病毒生命周期中的重要性
根據(jù)7月26日發(fā)表于開放獲取期刊PLOS Pathogens的一項(xiàng)研究,乳頭瘤病毒編碼的microRNA的發(fā)現(xiàn)支持了這些小分子在持續(xù)感染中的重要作用。研究作者德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校的Rachel Chirayil及其同事利用一種新方法對(duì)這一發(fā)現(xiàn)進(jìn)行了研究,該方法能夠?qū)哂谢蚪M數(shù)據(jù)但無法在實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中培養(yǎng)的大量病原體進(jìn)行microRNA鑒定。
乳頭狀瘤病毒可以在人類中引起幾種類型的癌癥,但仍然不清楚為什么只有一些感染導(dǎo)致惡性腫瘤的發(fā)展。要回答這個(gè)問題,有必要更好地表征乳頭瘤病毒基因產(chǎn)物及其在這些病原體生命周期中的作用。微小RNA是調(diào)節(jié)多種生物過程的小RNA,包括宿主 - 病原體相互作用。因此,microRNA通常由經(jīng)歷長期持續(xù)感染的病毒編碼。但到目前為止,還沒有發(fā)現(xiàn)廣泛接受的乳頭瘤病毒編碼的microRNA,部分原因是由于缺乏合適的實(shí)驗(yàn)室模型。
為克服這一障礙,研究人員開發(fā)了一種新的濕法技術(shù),稱為microRNA Discovery,通過強(qiáng)制基因組表達(dá)(miDGE)。這種廣泛適用的方法可以并行篩選多種病原體基因組,從缺乏實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)系統(tǒng)的生物體中鑒定microRNA。使用miDGE,他們篩選了超過73種不同的乳頭瘤病毒基因組,以編碼microRNAs。
大多數(shù)乳頭狀瘤病毒似乎沒有編碼微小RNA,但研究人員發(fā)現(xiàn)了五種新的極有可能的乳頭瘤病毒編碼的microRNA。盡管乳頭瘤病毒microRNA不在與高風(fēng)險(xiǎn)感染相關(guān)的癌癥中表達(dá),但它們中的一些可控制病毒基因表達(dá)。這組作者說,這些發(fā)現(xiàn)表明microRNAs是乳頭瘤病毒生命周期的重要調(diào)節(jié)因子。
“這項(xiàng)工作最重要的方面是這項(xiàng)新技術(shù)在一次實(shí)驗(yàn)中開辟了對(duì)眾多病原體的平行研究,”研究人員Christopher Sullivan補(bǔ)充道,“允許進(jìn)行深入的進(jìn)化交叉比較。在這里,鳥類病毒的洞察力幫助我們理解為什么有些人類乳頭狀瘤病毒會(huì)這樣做,同樣重要的是,為什么大多數(shù)人不會(huì)編碼自己的microRNAs。“
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