紅三葉草基因組測序

由英國基因組分析中心和英國阿伯里斯特威斯大學(xué)的Jose de Vega博士領(lǐng)導(dǎo)的一組基因研究人員成功測序了一種名為Milvus B的紅三葉草品種的基因組。

紅三葉草(Trifolium pratense)是多年生的，有時是兩年生草本植物，發(fā)生在巖石林地和灌木叢中。

該物種分布于世界各地。它原產(chǎn)于歐亞大陸和非洲北部，在溫帶地區(qū)廣泛歸化。它已在埃塞俄比亞，津巴布韋和南非的實驗苗圃中引入。

紅三葉草是牧區(qū)畜牧養(yǎng)殖系統(tǒng)中具有全球重要性的牧草豆科植物。由于其高產(chǎn)量和蛋白質(zhì)含量，營養(yǎng)價值和固定大氣氮的能力，它是草地農(nóng)業(yè)的一個有吸引力的組成部分。

“紅三葉草參考基因組的出版是一個重要的里程碑，因為它代表了三葉草飼料作物的第一個基因組序列，這是更可持續(xù)的畜牧業(yè)的關(guān)鍵組成部分，”de Vega博士說，他是第一作者?？茖W(xué)報告期刊上的論文。

“紅三葉草的基因組草圖將協(xié)助正在進行的育種計劃，通過加速從歐洲各地采集的一系列不同紅三葉草植物的有益特性的整合，用于可持續(xù)農(nóng)業(yè)。”

根據(jù)de Vega博士及其合作者的觀點，紅三葉草的基因組包含大約420兆堿基 - 這是4.2億堿基對的DNA字母。

他們說：“我們觀察到與桶三葉草(Medicago truncatula)的大塊保守同線，并估計這兩個物種在大約2300萬年前分化。”

“在40,868個注釋基因中，我們發(fā)現(xiàn)了涉及對飼料質(zhì)量和牲畜營養(yǎng)具有重要意義的生化途徑的基因簇。”

“基因組裝配的可用性將為基因組學(xué)輔助的飼料豆類育種方法鋪平道路，并為更深入了解飼料作物馴化的遺傳學(xué)提供平臺，”德維加博士說。

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