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      病毒喜歡耕種區(qū)域到自然區(qū)域
      
			
      
				2019-04-29 10:44:04
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      與非農業(yè)地區(qū)相比，農業(yè)地區(qū)受病毒性流行病的影響更大。這是一項國際研究的結果，該研究是法國 - 南非在西開普省和卡馬格地區(qū)的植物區(qū)合作的一部分。這些結果于2018年1月發(fā)表在ISME Journal上，這是一本微生物生態(tài)學雜志。
      

      病毒喜歡耕種區(qū)域到自然區(qū)域
      

      農業(yè)對植物病毒在環(huán)境中的分布和流行具有相當大的影響。在農業(yè)區(qū)，病毒感染的頻率明顯高于自然區(qū)。這是由Camargue(法國)和西開普省(南非)的國際科學家團隊進行的一項研究的結論，其結果于1月份在ISME期刊上發(fā)表。
      

      CIRAD植物病毒學研究人員Philippe Roumagnac解釋說：“與作物品種一樣，遺傳上相似的生物聚集和集中，助長了流行病。”該研究還表明，就微生物的生物多樣性而言尚未開發(fā)的“天然隔室”含有大量病毒。“與農業(yè)用地相鄰的地區(qū)可以使我們更好地了解植物病害的出現(xiàn)，”他說。
      

      雖然50%的新出現(xiàn)的植物病害是病毒，但仍然缺乏對植物病毒多樣性的了解。據(jù)官方統(tǒng)計，到目前為止，已經對大約1,400種植物病毒進行了表征和分類。這個數(shù)字可能遠遠低于植物病毒的真正多樣性，最近對陸地和海洋生態(tài)系統(tǒng)的探索表明了這一點。而且，這個數(shù)字無疑在兩個層面上被扭曲了。首先，病毒的描述幾乎完全基于極少數(shù)的農業(yè)植物物種進行，其次，大多數(shù)病毒僅在宿主出現(xiàn)癥狀后才被表征。“因此，我們對植物病毒世界的了解在多樣性方面仍然非常局部，但在農業(yè)生態(tài)系統(tǒng)層面的分布方面也是如此，”CIRAD的植物病毒學研究員Denis Filloux說。“缺乏知識是我們理解農業(yè)生態(tài)系統(tǒng)全球功能，以及新植物病毒病出現(xiàn)中風險因素的定義和量化或解決這些疾病的策略設計的障礙。”剩余待鑒定的大多數(shù)病毒存在于人類活動很少的區(qū)域。
      

      為了達到這個結果，科學家采用了一種新的病毒宏基因組學方法。“Metagenomics是一種對填充給定環(huán)境的微生物的所有基因組進行高通量測序的方法，”Philippe Roumagnac解釋說。“例如，它使我們能夠進入病毒體，換句話說，所有病毒序列都包含在宿主生物體或含有幾種潛在宿主的樣本中。”
      

      自2009年以來，植物病理學中出現(xiàn)了新一代宏基因組學研究，不僅可以分析生態(tài)系統(tǒng)或生物體的整體基因組，還可以將病原體序列與宿主和/或地理位置直接聯(lián)系起來。 。空間宏基因組學的這項原始研究通過揭示許多被分析的植物是病毒感染的，徹底改變了植物病毒分布的觀點。
      
			

			
        
      
			
      
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